La familia de genes BBX funciona como un factor de transcripción clave implicado en el crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés de las plantas. Sin embargo, la investigación sobre esta familia de genes en el melón sigue ausente. En el presente estudio, identificamos 19 genes de la familia BBX dentro del genoma del melón, distribuidos en los cromosomas 1, 2, 3, 4, 5, 7, 8, 10, 11 y 12. El análisis filogenético categorizó estos genes en cinco subfamilias distintas, con similitudes notables observadas en la estructura de los genes y motivos conservados entre los miembros de la misma subfamilia. El análisis de sinonimia reveló siete relaciones sinónimas entre los genes BBX del melón, 17 entre el melón y , y una entre el melón y el arroz. La reanálisis de los datos del transcriptoma indicó que ciertos genes BBX exhiben altos niveles de expresión en varios tejidos y etapas de desarrollo de los frutos, mientras que otros muestran especificidad tisular. Bajo condiciones de estrés abiótico y biótico, genes como , , , , , y demostraron una expresión diferencial significativa, destacando sus roles críticos en el crecimiento y desarrollo del melón. Además, se realizó un análisis de RT-qPCR para examinar los niveles de expresión de los genes BBX del melón en diferentes momentos bajo estrés salino, validando aún más los datos del transcriptoma. Este estudio proporciona una base teórica para futuros esfuerzos de mejoramiento molecular en el melón.