Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de factores reguladores del crecimiento en Oliver (Du-Zhong)
Autores: Wang, Ruoruo; Zhu, Ying; Zhao, Degang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a nivel genómico y análisis de expresión de factores reguladores del crecimiento en Oliver (Du-Zhong)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Raíces
Hojas
Genes
Factores reguladores del crecimiento
Genoma
Expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Las raíces, tallos, hojas y semillas contienen una gran cantidad de trans-poliisopreno (también conocido como Eu-goma), que se considera una planta laticífera importante con valiosas aplicaciones industriales. La Eu-goma utilizada en la industria se extrae principalmente de las hojas. Por lo tanto, es de gran importancia identificar los genes relacionados con la regulación del tamaño de las hojas. Los factores reguladores del crecimiento de las plantas (GRFs) desempeñan roles importantes en la regulación del tamaño de las hojas, y sus funciones están altamente conservadas entre diferentes especies de plantas. Sin embargo, hasta ahora ha habido informes muy limitados sobre EuGRFs. En este estudio, se identificaron ocho EuGRFs canónicos con dominios QLQ y WRC y dos eul-miR396s putativos en el genoma a nivel de cromosoma. Se encontró que, a diferencia de AtGRFs, todos los EuGRFs contienen el sitio de unión de miR396s en el extremo de los dominios WRC. Estos se distribuyeron en seis cromosomas en el genoma. El análisis de colinealidad del genoma reveló que y exhiben relaciones colineales con, sugiriendo que esos tres genes pueden haber surgido a través de eventos de replicación génica. La relación colineal entre, y mostró que y no tenían miembros colineales en y arroz. Casi todos muestran un nivel de expresión más alto en tejidos en crecimiento y desarrollo, y la mayoría de los promotores procesan elementos cis inducidos por hormonas vegetales y estrés. Además, encontramos que la expresión fue significativamente inducida por giberelinas (GA) en tres horas, y la altura de las plántulas aumentó significativamente una semana después del tratamiento con GA. Los hallazgos de este estudio proporcionan genes candidatos potenciales para investigaciones futuras y sientan las bases para explorar más a fondo el mecanismo molecular subyacente al desarrollo en respuesta a GA.
Descripción
Las raíces, tallos, hojas y semillas contienen una gran cantidad de trans-poliisopreno (también conocido como Eu-goma), que se considera una planta laticífera importante con valiosas aplicaciones industriales. La Eu-goma utilizada en la industria se extrae principalmente de las hojas. Por lo tanto, es de gran importancia identificar los genes relacionados con la regulación del tamaño de las hojas. Los factores reguladores del crecimiento de las plantas (GRFs) desempeñan roles importantes en la regulación del tamaño de las hojas, y sus funciones están altamente conservadas entre diferentes especies de plantas. Sin embargo, hasta ahora ha habido informes muy limitados sobre EuGRFs. En este estudio, se identificaron ocho EuGRFs canónicos con dominios QLQ y WRC y dos eul-miR396s putativos en el genoma a nivel de cromosoma. Se encontró que, a diferencia de AtGRFs, todos los EuGRFs contienen el sitio de unión de miR396s en el extremo de los dominios WRC. Estos se distribuyeron en seis cromosomas en el genoma. El análisis de colinealidad del genoma reveló que y exhiben relaciones colineales con, sugiriendo que esos tres genes pueden haber surgido a través de eventos de replicación génica. La relación colineal entre, y mostró que y no tenían miembros colineales en y arroz. Casi todos muestran un nivel de expresión más alto en tejidos en crecimiento y desarrollo, y la mayoría de los promotores procesan elementos cis inducidos por hormonas vegetales y estrés. Además, encontramos que la expresión fue significativamente inducida por giberelinas (GA) en tres horas, y la altura de las plántulas aumentó significativamente una semana después del tratamiento con GA. Los hallazgos de este estudio proporcionan genes candidatos potenciales para investigaciones futuras y sientan las bases para explorar más a fondo el mecanismo molecular subyacente al desarrollo en respuesta a GA.