Las cabras con diversos rasgos fenotípicos económicos desempeñan un papel importante en la ganadería. Sin embargo, los mecanismos genéticos subyacentes a los rasgos fenotípicos complejos no están claros en las cabras. Los estudios genómicos de variaciones proporcionaron una perspectiva para identificar genes funcionales. El trabajo tuvo como objetivo buscar genes candidatos relacionados con las medidas corporales y el peso corporal de las cabras Karachai y desarrollar un sistema de prueba experimental PCR-RV para genotipar SNPs significativos. La comparación de los resultados de GWAS para las edades de 4 y 8 meses reveló 58 SNPs comunes para genotipos significativos. Se identificaron 11 SNPs comunes para el peso corporal, 4 SNPs para el grupo de rasgos de altura a la cruz, altura de la grupa, longitud del cuerpo, 2 SNPs para altura a la cruz y altura de la grupa, 1 SNP para longitud del cuerpo y profundidad del pecho. La anotación estructural de las regiones genómicas que cubren una ventana de +/-0.20 Mb mostró la presencia de 288 genes; 52 de ellos tenían funciones descritas de acuerdo con la ontología genética. Las principales funciones moleculares de las proteínas codificadas por estos genes son la regulación de la transcripción, la proliferación celular, la angiogénesis, el crecimiento corporal, el metabolismo de ácidos grasos y lípidos, el desarrollo del sistema nervioso y la espermatogénesis. Se seleccionaron SNPs comunes al peso corporal y localizados dentro de una ventana de +/-200 kb de los genes estructurales para crear un sistema de prueba. El estudio de la productividad cárnica después del sacrificio y el análisis químico del tejido muscular en cabras Karachai a la edad de 8 meses de diferentes genotipos según los SNPs identificados reveló que rs268269710 es el más prometedor para futuras investigaciones y uso en la cría. El genotipo GG está asociado con un mayor peso vivo de los animales, un mayor rendimiento de la canal, el contenido de la parte sin hueso en ella y la relación de proteína y tejido adiposo en la carne preferida para la nutrición dietética. Estos resultados contribuirán a la mejora genética de las cabras Karachai.