Los análisis de asociación a nivel del genoma revelan genes candidatos que controlan el índice de cosecha y rasgos agronómicos relacionados en L
Autores: Qin, Mengfan; Song, Jia; Guo, Na; Zhang, Miao; Zhu, Yunlin; Huang, Zhen; Xu, Aixia
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Los análisis de asociación a nivel del genoma revelan genes candidatos que controlan el índice de cosecha y rasgos agronómicos relacionados en L
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
índice de cosecha
Colza
SNPs
Rasgos agronómicos
Mecanismos genéticos
Marcador molecular
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 23
Citaciones: Sin citaciones
El índice de cosecha (HI) es un rasgo agronómico complejo y vital que está estrechamente relacionado con los beneficios económicos del colza. En este estudio, medimos el HI y 13 rasgos agronómicos relacionados con el HI de 104 líneas de cría básicas de colza durante 3 años y secuenciamos las poblaciones utilizando el conjunto de chips Bnapus50K. Los análisis fenotípicos mostraron las conexiones complejas entre el HI y otros rasgos. Se identificaron un total de 212 SNPs significativos relacionados con los rasgos y 22 SNPs estables. Cuatro SNPs, A01_1783685 (PH y SYP), C06_26638717 (PH y NSS), C03_4731660 (MIL y MINS) y C09_36899682 (PH y BYP), fueron identificados como loci pleiotrópicos potenciales. En comparación con informes anteriores, se obtuvieron 49 loci de consenso relacionados con PH, TSW, NSP, BAI, NSS, SL, BN, MINS, SYP y BYP. Se detectaron doce SNPs estables como loci novedosos prometedores relacionados con BN (A05_19368584 y A05_19764389), SL (A06_23598999, A06_23608274 y C07_38735522), PH (C04_47349279, C04_47585236 y C09_36899680), MINS (C05_6251826), NSS (C06_22559430 y C06_22570315) y HI (C05_6554451). Además, se identificaron 39 genes putativos en los intervalos candidatos. Este estudio proporciona nuevas perspectivas sobre los mecanismos genéticos de HI y los rasgos relacionados con HI, sentando las bases para el desarrollo de marcadores moleculares y la clonación de genes casuales para mejorar el índice de cosecha del colza.
Descripción
El índice de cosecha (HI) es un rasgo agronómico complejo y vital que está estrechamente relacionado con los beneficios económicos del colza. En este estudio, medimos el HI y 13 rasgos agronómicos relacionados con el HI de 104 líneas de cría básicas de colza durante 3 años y secuenciamos las poblaciones utilizando el conjunto de chips Bnapus50K. Los análisis fenotípicos mostraron las conexiones complejas entre el HI y otros rasgos. Se identificaron un total de 212 SNPs significativos relacionados con los rasgos y 22 SNPs estables. Cuatro SNPs, A01_1783685 (PH y SYP), C06_26638717 (PH y NSS), C03_4731660 (MIL y MINS) y C09_36899682 (PH y BYP), fueron identificados como loci pleiotrópicos potenciales. En comparación con informes anteriores, se obtuvieron 49 loci de consenso relacionados con PH, TSW, NSP, BAI, NSS, SL, BN, MINS, SYP y BYP. Se detectaron doce SNPs estables como loci novedosos prometedores relacionados con BN (A05_19368584 y A05_19764389), SL (A06_23598999, A06_23608274 y C07_38735522), PH (C04_47349279, C04_47585236 y C09_36899680), MINS (C05_6251826), NSS (C06_22559430 y C06_22570315) y HI (C05_6554451). Además, se identificaron 39 genes putativos en los intervalos candidatos. Este estudio proporciona nuevas perspectivas sobre los mecanismos genéticos de HI y los rasgos relacionados con HI, sentando las bases para el desarrollo de marcadores moleculares y la clonación de genes casuales para mejorar el índice de cosecha del colza.