Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes de fosfolipasa C revela ortólogos, redes de co-expresión y perfil de expresión bajo estrés abiótico en
Autores: Wang, Hongcheng; Yu, Junxing; Zhang, Xingyu; Zeng, Qian; Zeng, Tuo; Gu, Lei; Zhu, Bin; Yu, Feng; Du, Xuye
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes de fosfolipasa C revela ortólogos, redes de co-expresión y perfil de expresión bajo estrés abiótico en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Fosfolipasa c
Sorgo
Estrés abiótico
Redes de coexpresión génica
Patrones de expresión
Estímulos ambientales
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La fosfolipasa C (PLC) es una enzima esencial involucrada en las vías de señalización lipídica, cruciales para regular el crecimiento de las plantas y responder al estrés ambiental. En el sorgo, se han identificado 11 genes de PLC, que comprenden 6 y 5. A través de análisis filogenéticos y de colinealidad inter-especies, se han observado similitudes estructurales entre las proteínas SbPLCs y ZmPLCs, con una colinealidad particularmente fuerte entre SbPLCs y OsPLCs. El análisis de la función del promotor ha demostrado que están significativamente enriquecidos bajo estrés abiótico y estímulos hormonales, como ABA, ácido jasmonico, sequía, alta temperatura y sal. Las redes de coexpresión génica, construidas utilizando un análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA), destacan patrones de expresión distintos de, , y en respuesta al estrés abiótico, proporcionando más información sobre los patrones de expresión e interacciones de bajo diversos estímulos ambientales. Los resultados de qRT-PCR revelan variaciones en los niveles de expresión entre la mayoría de los miembros bajo diferentes condiciones de estrés (sequía, NaCl, NaHCO), tratamientos hormonales (ABA) y etapas de desarrollo, indicando patrones de expresión tanto específicos como superpuestos. Este análisis integral ofrece valiosos conocimientos sobre los roles de en el sorgo, arrojando luz sobre sus patrones de expresión específicos, elementos reguladores e interacciones proteicas a través de diferentes estímulos ambientales y etapas de desarrollo.
Descripción
La fosfolipasa C (PLC) es una enzima esencial involucrada en las vías de señalización lipídica, cruciales para regular el crecimiento de las plantas y responder al estrés ambiental. En el sorgo, se han identificado 11 genes de PLC, que comprenden 6 y 5. A través de análisis filogenéticos y de colinealidad inter-especies, se han observado similitudes estructurales entre las proteínas SbPLCs y ZmPLCs, con una colinealidad particularmente fuerte entre SbPLCs y OsPLCs. El análisis de la función del promotor ha demostrado que están significativamente enriquecidos bajo estrés abiótico y estímulos hormonales, como ABA, ácido jasmonico, sequía, alta temperatura y sal. Las redes de coexpresión génica, construidas utilizando un análisis de red de coexpresión génica ponderada (WGCNA), destacan patrones de expresión distintos de, , y en respuesta al estrés abiótico, proporcionando más información sobre los patrones de expresión e interacciones de bajo diversos estímulos ambientales. Los resultados de qRT-PCR revelan variaciones en los niveles de expresión entre la mayoría de los miembros bajo diferentes condiciones de estrés (sequía, NaCl, NaHCO), tratamientos hormonales (ABA) y etapas de desarrollo, indicando patrones de expresión tanto específicos como superpuestos. Este análisis integral ofrece valiosos conocimientos sobre los roles de en el sorgo, arrojando luz sobre sus patrones de expresión específicos, elementos reguladores e interacciones proteicas a través de diferentes estímulos ambientales y etapas de desarrollo.