La minería de genes de tolerancia a la sal es significativa para la crianza de variedades de arroz tolerantes a la sal de alta calidad con el fin de mejorar la utilización de tierras salinas y alcalinas. En este estudio, se midieron 173 accesiones de arroz para su potencial de germinación (PG), tasa de germinación (TG), longitud de plántula (LP), longitud de raíz (LR), potencial de germinación relativo a la tasa de daño por sal (PGR), tasa de germinación relativa a la tasa de daño por sal (TGR), longitud de plántula relativa a la tasa de daño por sal (LPR), tasa de daño por sal relativa en la etapa de germinación (TDR) y tasa de daño por sal relativa integral en la etapa temprana de plántula (TDRI) bajo condiciones normales y de estrés salino. Se realizó un análisis de asociación a nivel genómico con 1,322,884 SNPs de alta calidad obtenidos mediante resecuenciación. Se detectaron ocho loci de rasgos cuantitativos (QTLs) relacionados con rasgos de tolerancia a la sal en la etapa de germinación en 2020 y 2021. Estuvieron relacionados con el PGR y el LPR, que fueron descubiertos recientemente en este estudio. Se predijeron tres genes como genes candidatos de tolerancia a la sal: , y . En la actualidad, la selección asistida por marcadores (MAS) y la crianza editada por genes están convirtiéndose en más comunes. Nuestro descubrimiento de genes candidatos proporciona una referencia para la investigación en este campo. Los alelos élite identificados en este estudio pueden proporcionar una base molecular para cultivar variedades de arroz tolerantes a la sal.