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Análisis a nivel genómico de la familia de genes bHLH en var.: Identificación, clasificación, evolución y diversidad de patrones de expresión bajo cultivo

Autores: Liu, Yang; Lin, Ling; Mo, Qiong; Zhang, Damao; Li, Weidong; Xiong, Xingyao; Yu, Xiaoying; Li, Yanlin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Análisis a nivel genómico de la familia de genes bHLH en var.: Identificación, clasificación, evolución y diversidad de patrones de expresión bajo cultivo


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Factor de transcripción
BHLH
Biosíntesis
Antocianina
Genes
Crecimiento

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 14

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La familia de factores de transcripción de hélice-bucle-hélice básica (bHLH) es la segunda familia de factores de transcripción más grande en las plantas. Los miembros de esta familia están involucrados en los procesos de crecimiento y desarrollo, biosíntesis de metabolitos secundarios, transducción de señales y resistencia de las plantas. var. es una planta leñosa crítica con altos valores ornamentales y económicos, que se ha utilizado como arquitectura ornamental y plantas de medicina herbal tradicional china. Sin embargo, los factores de transcripción bHLH en var. (var.) aún no se han demostrado sistemáticamente, y su papel en la biosíntesis de antocianinas sigue siendo incierto. Aquí, identificamos 165 genes potenciales utilizando dos métodos, y estaban distribuidos de manera desigual en los cromosomas 1 a 12 del genoma de var. . Basado en una comparación evolutiva con proteínas de y , estas proteínas bHLH se categorizaron en 21 subfamilias. La mayoría de los LcbHLHs en una subfamilia particular tenían estructuras genéticas similares y motivos conservados. La anotación de Gene Ontology y los elementos cis predijeron que tenían muchas funciones moleculares y estaban involucrados en procesos de crecimiento de las plantas, incluida la biosíntesis de flavonoides y antocianinas. El análisis transcriptómico reveló diferentes patrones de expresión entre diferentes tejidos y cultivares de var. . Muchos se expresaron en las hojas, y solo unos pocos genes se expresaron en alta cantidad en las flores. Se identificaron seis genes candidatos mediante análisis bioinformáticos y análisis de expresión. Un análisis adicional de PCR cuantitativa en tiempo real y un análisis de red de interacción de proteínas mostraron que LcbHLH156, que es una de las proteínas candidatas pertenecientes a la subfamilia IIIf, podría interactuar con proteínas relacionadas con la síntesis de antocianinas. Por lo tanto, se expresó de forma transitoria en var. para verificar su función en la regulación de la síntesis de antocianinas. En comparación con el grupo de control, la acumulación de pigmento rojo apareció en la herida después de la inyección, y el contenido total de antocianinas aumentó en la herida de las hojas. Estos resultados sientan una base para la investigación del mecanismo de regulación de los colores de las hojas en var. y también proporcionan una base para la función de la familia LcbHLH.

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