Análisis genómico de factores de transcripción relacionados con la embriogénesis somática en fresa cultivada ( x ) y relaciones evolutivas entre especies de Rosáceas
Autores: Garrido-Bigotes, Adrián; Silva, Herman; Hasbún, Rodrigo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Análisis genómico de factores de transcripción relacionados con la embriogénesis somática en fresa cultivada ( x ) y relaciones evolutivas entre especies de Rosáceas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Embriogénesis somática
Factores de transcripción
Familia Rosaceae
Caracterización in silico
Mecanismos moleculares
Sistemas de propagación
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 24
Citaciones: Sin citaciones
La embriogénesis somática es un método de regeneración de plantas comúnmente utilizado en cultivos de tejidos. Sus mecanismos moleculares son bien conocidos en plantas modelo como L. Los genes (), (), (), (), y () son considerados reguladores principales en la inducción, crecimiento y maduración de embriones somáticos. Sin embargo, el estudio de estos factores de transcripción en cultivos de frutas con alto valor agronómico y económico como la fresa cultivada ( x Duch.) y otras especies de la familia Rosaceae es escaso. El propósito de este estudio fue la caracterización in silico de los genes , , , , y del genoma de x y el estudio de las relaciones evolutivas dentro de la familia Rosaceae. Se realizaron análisis de sintenia y tasas evolutivas moleculares para analizar la evolución de cada factor de transcripción dentro de la familia Rosaceae. La sintenia fue conservada entre x y otros genomas de Rosaceae, y los genes parálogos fueron seleccionados a través de selección negativa. Además, la organización de exones-intrones y alineamientos múltiples mostraron que la estructura génica y los dominios de unión al ADN estaban conservados en los factores de transcripción de x. Finalmente, los árboles filogenéticos mostraron relaciones evolutivas cercanas entre x y sus proteínas ortólogas en la subfamilia Rosoideae. En general, esta investigación reveló nuevas perspectivas en la red LAFL-B en x y otras especies de la familia Rosaceae. Estos resultados proporcionan información útil in silico y nuevos recursos para el establecimiento de sistemas de propagación más eficientes o el estudio de los efectos de la ploidía en la embriogénesis somática.
Descripción
La embriogénesis somática es un método de regeneración de plantas comúnmente utilizado en cultivos de tejidos. Sus mecanismos moleculares son bien conocidos en plantas modelo como L. Los genes (), (), (), (), y () son considerados reguladores principales en la inducción, crecimiento y maduración de embriones somáticos. Sin embargo, el estudio de estos factores de transcripción en cultivos de frutas con alto valor agronómico y económico como la fresa cultivada ( x Duch.) y otras especies de la familia Rosaceae es escaso. El propósito de este estudio fue la caracterización in silico de los genes , , , , y del genoma de x y el estudio de las relaciones evolutivas dentro de la familia Rosaceae. Se realizaron análisis de sintenia y tasas evolutivas moleculares para analizar la evolución de cada factor de transcripción dentro de la familia Rosaceae. La sintenia fue conservada entre x y otros genomas de Rosaceae, y los genes parálogos fueron seleccionados a través de selección negativa. Además, la organización de exones-intrones y alineamientos múltiples mostraron que la estructura génica y los dominios de unión al ADN estaban conservados en los factores de transcripción de x. Finalmente, los árboles filogenéticos mostraron relaciones evolutivas cercanas entre x y sus proteínas ortólogas en la subfamilia Rosoideae. En general, esta investigación reveló nuevas perspectivas en la red LAFL-B en x y otras especies de la familia Rosaceae. Estos resultados proporcionan información útil in silico y nuevos recursos para el establecimiento de sistemas de propagación más eficientes o el estudio de los efectos de la ploidía en la embriogénesis somática.