La trisomía que alberga una copia extra del cromosoma generalmente causa una variedad de discapacidades físicas e intelectuales en los mamíferos, pero es un stock genético extremadamente raro e importante en las plantas. En este estudio, se encontró una planta de trisomía espontánea en un acceso de col china (var., CC, 2 = 18) que mostró una arquitectura de planta significativamente más pequeña en comparación con otras plantas normales, y se confirmó posteriormente mediante un análisis citológico en el que se observaron un conjunto de cromosomas de 2 = 19 y un comportamiento cromosómico anormal. Luego, basándose en la desviación de la expresión génica determinada por RNA-seq, se identificó que la copia extra del cromosoma en esta trisomía era el cromosoma C2 (TC2). En comparación con las plantas normales, TC2 no solo mostró genes expresados diferencialmente (DEGs) generalmente regulados al alza en el cromosoma C2 (97.21% de 573 DEGs en el cromosoma C2), sino que también exhibió una perturbación en la expresión del genoma completo, en la que se observaron 1329 DEGs (69.87% del total de DEGs) a lo largo de los cromosomas de dos copias (-efecto). Los genes en los grupos alto (valor de expresión génica > 100) y medio (100 > valor de expresión génica > 10) fueron más propensos a una disminución de la expresión génica, pero los genes en el grupo bajo (10 > valor de expresión génica > 0.1) mostraron una desviación de expresión regulada al alza. Además, el análisis de anotación GO (ontología génica) reveló que los DEGs regulados al alza en el grupo -efecto estaban sobrerrepresentados por los genes involucrados en la categoría de respuesta al estrés, mientras que los DEGs regulados a la baja en el grupo -efecto estaban en su mayoría enriquecidos en vías relacionadas con la síntesis de ADN. En conclusión, creemos que nuestros resultados pueden proporcionar recursos importantes para el análisis genético y mostrar algunas ideas novedosas para comprender la biología de las plantas de trisomía.