La cría de ovejas es un sector importante de la producción ganadera en la República de Kazajistán. La oveja kazaja de cola gorda y lana gruesa ocupa una posición destacada entre las razas locales debido a su alta productividad cárnica, resistencia a condiciones climáticas extremas y uso eficiente de los recursos de pastoreo. Este estudio se centra en el análisis de los segmentos de homocigosidad (ROH) para evaluar el nivel de diversidad genética, la endogamia y detectar firmas de selección en la raza de oveja kazaja de cola gorda y lana gruesa. Un total de 500 animales fueron genotipados utilizando el OvineSNP50 BeadChip (Illumina, San Diego, CA, EE. UU.). Como resultado, se identificaron un total de 41,728 segmentos de ROH, con una longitud promedio de 1.59 Mb, distribuidos por todo el genoma. Las regiones homocigotas más prominentes se detectaron en los cromosomas OAR10, OAR13 y OAR22, que podrían estar asociadas con firmas de selección. Los coeficientes de endogamia genómica (F y F) mostraron una fuerte correlación positiva ( = 0.58, < 0.001), lo que apoya la efectividad del análisis basado en ROH. Se detectaron varios genes candidatos, incluyendo , , , y que están notablemente involucrados en la formación de músculo, características de la lana y el metabolismo de grasas. Los hallazgos tienen un valor práctico sustancial para los programas de cría y para la gestión de la diversidad genética en las empresas de cría de ovejas en la República de Kazajistán.