Análisis genómico de los genes de la familia CCT de la papa y su respuesta a sustancias de auxina
Autores: Huang, Xiongjie; Yang, Jingtian; Bai, Yiting; Liu, Lei; Liu, Fang; Cui, Qi; Liu, Yuan; Chen, Youjun; Zhang, Wenlu; Li, Juan; Zhang, Shengyan; Chen, Chen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis genómico de los genes de la familia CCT de la papa y su respuesta a sustancias de auxina
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Tiempo de floración
Tubérculos de patata
Genes de la familia StCCT
Eventos de duplicación génica
Patrones de expresión
Cría molecular
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 22
Citaciones: Sin citaciones
El control del tiempo de floración juega un papel importante en el crecimiento y desarrollo de los tubérculos de papa. La familia de genes (, y ) está involucrada en el proceso de floración de las plantas. En este estudio, se identificaron un total de 32 genes de la familia StCCT y se clasificaron en cinco subfamilias, incluyendo COL (17 miembros), PRR (4 miembros), ZIM (3 miembros), ASML2 (6 miembros) y TCR1 (2 miembros), basados en su relación filogenética. Un análisis de la estructura génica, composiciones de motivos y dominio conservado proporcionó apoyo para esta clasificación. Los genes estaban distribuidos de manera desigual en 12 cromosomas de la planta de papa. En total, se observaron seis eventos de duplicación génica, los cuales jugaron un papel crucial en la expansión de los genes de la familia StCCT en la papa. Los perfiles de expresión exhibieron patrones de expresión diversos de los genes en seis tejidos (hoja, brote, raíz, tubérculo, estolón y flor), solo se expresa en las flores, mientras que y se expresan altamente en flores y tubérculos, respectivamente. Los genes muestran diferentes patrones de expresión en respuesta a tratamientos de IAA y TIBA en diferentes concentraciones a lo largo de tres tejidos (hoja, tallo y tubérculo). Después de los tratamientos con IAA y TIBA, se encontró que el nivel de expresión de era bajo en hojas y tallos pero aumentó significativamente en tubérculos. En conjunto, este estudio proporcionó información valiosa para el estudio adicional de la formación y desarrollo de la papa y proporcionó genes candidatos para la cría molecular en la papa.
Descripción
El control del tiempo de floración juega un papel importante en el crecimiento y desarrollo de los tubérculos de papa. La familia de genes (, y ) está involucrada en el proceso de floración de las plantas. En este estudio, se identificaron un total de 32 genes de la familia StCCT y se clasificaron en cinco subfamilias, incluyendo COL (17 miembros), PRR (4 miembros), ZIM (3 miembros), ASML2 (6 miembros) y TCR1 (2 miembros), basados en su relación filogenética. Un análisis de la estructura génica, composiciones de motivos y dominio conservado proporcionó apoyo para esta clasificación. Los genes estaban distribuidos de manera desigual en 12 cromosomas de la planta de papa. En total, se observaron seis eventos de duplicación génica, los cuales jugaron un papel crucial en la expansión de los genes de la familia StCCT en la papa. Los perfiles de expresión exhibieron patrones de expresión diversos de los genes en seis tejidos (hoja, brote, raíz, tubérculo, estolón y flor), solo se expresa en las flores, mientras que y se expresan altamente en flores y tubérculos, respectivamente. Los genes muestran diferentes patrones de expresión en respuesta a tratamientos de IAA y TIBA en diferentes concentraciones a lo largo de tres tejidos (hoja, tallo y tubérculo). Después de los tratamientos con IAA y TIBA, se encontró que el nivel de expresión de era bajo en hojas y tallos pero aumentó significativamente en tubérculos. En conjunto, este estudio proporcionó información valiosa para el estudio adicional de la formación y desarrollo de la papa y proporcionó genes candidatos para la cría molecular en la papa.