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Análisis conjunto de la expresión de lncRNA y mRNA a nivel del genoma durante la respuesta al ácido salicílico en

Autores: Zhang, Chao; Dong, Yan; Ren, Yachao; Wang, Shijie; Yang, Minsheng

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Análisis conjunto de la expresión de lncRNA y mRNA a nivel del genoma durante la respuesta al ácido salicílico en


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

LncARNs
Plantas
Respuestas hormonales
ácido salicílico
Secuenciación de ARN
Expresión génica

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 16

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los ARN largos no codificantes (lncARN) participan en una amplia gama de procesos biológicos, pero los lncARN en plantas siguen siendo en gran medida desconocidos; en particular, carecemos de una identificación sistemática de los lncARN vegetales involucrados en las respuestas hormonales. Para explorar el mecanismo molecular de la respuesta del álamo al ácido salicílico (AS), se estudiaron los cambios en las enzimas protectoras, que están estrechamente relacionadas con la resistencia de las plantas inducida por el AS exógeno, y se determinó la expresión de ARNm y lncARN mediante secuenciación de ARN de alto rendimiento. Los resultados mostraron que las actividades de la fenilalanina amoníaco liasa (PAL) y la polifenol oxidasa (PPO), en las hojas de , se incrementaron significativamente por la aplicación de AS exógeno. La secuenciación de ARN de alto rendimiento mostró que se detectaron 26,366 genes y 5690 lncARN bajo las diferentes condiciones de tratamiento: aplicación de AS y HO. Entre estos, 606 genes y 49 lncARN se expresaron de manera diferencial. Según la predicción de objetivos, los lncARN y los genes objetivo involucrados en la respuesta a la luz, la respuesta al estrés, la resistencia a enfermedades de las plantas y el crecimiento y desarrollo, se expresaron de manera diferencial en las hojas tratadas con AS. El análisis de interacción mostró que las interacciones lncARN-ARNm, tras el AS exógeno, estaban involucradas en la respuesta de las hojas de álamo al entorno externo. Nuestro estudio proporciona una visión integral de los lncARN y ofrece información sobre las posibles funciones e interacciones regulatorias de los lncARN sensibles al AS, formando así la base para futuros análisis funcionales de los lncARN sensibles al AS en .

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