Análisis exhaustivo de los miembros de la familia GASA en el genoma del cacahuete: identificación, caracterización y sus expresiones en respuesta al desarrollo de la vaina
Autores: Wu, Yue; Sun, Ziqi; Qi, Feiyan; Zhao, Mingbo; Dong, Wenzhao; Huang, Bingyan; Zheng, Zheng; Zhang, Xinyou
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Análisis exhaustivo de los miembros de la familia GASA en el genoma del cacahuete: identificación, caracterización y sus expresiones en respuesta al desarrollo de la vaina
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
ácido giberélico
Arabidopsis
Familia de genes GASA
Bioinformática
Análisis filogenético
Vainas de cacahuete
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 36
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes estimulados por ácido giberélico de Arabidopsis (GASA) es esencial para el crecimiento y desarrollo de las plantas, el control de los niveles hormonales y la transmisión de señales de fitohormonas. Diferentes plantas han demostrado contener numerosos homólogos de GASA. Sin embargo, no se tiene conocimiento sobre estas proteínas en cacahuetes. En el estudio actual, realizamos un exhaustivo análisis bioinformático y de expresión y encontramos 20, 22 y 40 genes GASA mediante análisis a nivel genómico de L., , y , respectivamente. Analizamos y predijimos las propiedades físicas de estos genes. Según los resultados de nuestro análisis filogenético, el árbol evolutivo construido a partir de los 40 proteínas AhGASA se dividió en siete categorías, formando un total de 14 pares de genes. Según nuestras observaciones, la duplicación en tándem es un factor significativo en la expansión de la familia de genes GASA. AhGASA estaba distribuido de manera desigual en 20 cromosomas, y se identificaron 17 genes duplicados en tándem. Un análisis de co-línea con el subgenoma A/B identificó 69 pares de genes homólogos lineales/paralelos. Un análisis de elementos cis reveló que la proteína AhGASA es crucial para la respuesta hormonal. En materiales con diferentes rasgos de tamaño en diversas etapas del desarrollo del cacahuete, los análisis de transcriptómica y RT-qPCR revelaron que los genes AhGASA se expresan a diferentes niveles y son específicos del tejido. Este hallazgo sugiere que algunos genes AhGASA pueden estar involucrados en el control del tamaño de las vainas de cacahuete. Este estudio sugiere que los genes GASA son cruciales para controlar el desarrollo de las vainas de cacahuete y proporciona la primera identificación y análisis sistemático de genes GASA en el cacahuete. Estos hallazgos ayudarán en futuras investigaciones sobre la función del gen GASA en el cacahuete cultivado.
Descripción
La familia de genes estimulados por ácido giberélico de Arabidopsis (GASA) es esencial para el crecimiento y desarrollo de las plantas, el control de los niveles hormonales y la transmisión de señales de fitohormonas. Diferentes plantas han demostrado contener numerosos homólogos de GASA. Sin embargo, no se tiene conocimiento sobre estas proteínas en cacahuetes. En el estudio actual, realizamos un exhaustivo análisis bioinformático y de expresión y encontramos 20, 22 y 40 genes GASA mediante análisis a nivel genómico de L., , y , respectivamente. Analizamos y predijimos las propiedades físicas de estos genes. Según los resultados de nuestro análisis filogenético, el árbol evolutivo construido a partir de los 40 proteínas AhGASA se dividió en siete categorías, formando un total de 14 pares de genes. Según nuestras observaciones, la duplicación en tándem es un factor significativo en la expansión de la familia de genes GASA. AhGASA estaba distribuido de manera desigual en 20 cromosomas, y se identificaron 17 genes duplicados en tándem. Un análisis de co-línea con el subgenoma A/B identificó 69 pares de genes homólogos lineales/paralelos. Un análisis de elementos cis reveló que la proteína AhGASA es crucial para la respuesta hormonal. En materiales con diferentes rasgos de tamaño en diversas etapas del desarrollo del cacahuete, los análisis de transcriptómica y RT-qPCR revelaron que los genes AhGASA se expresan a diferentes niveles y son específicos del tejido. Este hallazgo sugiere que algunos genes AhGASA pueden estar involucrados en el control del tamaño de las vainas de cacahuete. Este estudio sugiere que los genes GASA son cruciales para controlar el desarrollo de las vainas de cacahuete y proporciona la primera identificación y análisis sistemático de genes GASA en el cacahuete. Estos hallazgos ayudarán en futuras investigaciones sobre la función del gen GASA en el cacahuete cultivado.