Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes de factores de transcripción de respuesta a auxinas en
Autores: Shi, Yunzhu; Mu, Zixuan; Meng, Xiangyu; Li, Xiang; Zou, Lingxuan; Zhu, Xuli; Bo, Wenhao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes de factores de transcripción de respuesta a auxinas en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factor de respuesta a auxinas
Factor de transcripción específico de plantas
Procesos biológicos
Familia de genes
Relaciones evolutivas
Mecanismos moleculares
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
El factor de respuesta a auxinas (ARF) es un factor de transcripción específico de plantas que responde a cambios en los niveles de auxinas, regulando varios procesos biológicos en las plantas, como el desarrollo de flores, la senescencia, la formación de raíces laterales, la respuesta al estrés y la acumulación de metabolitos secundarios. En este estudio, identificamos la familia de genes ARF en Oliv. utilizando análisis bioinformáticos, examinando sus dominios estructurales conservados, la estructura del gen, los productos de expresión y las relaciones evolutivas. Encontramos que los 34 genes estaban distribuidos de manera desigual en 19 cromosomas de . Todas las 56 proteínas PeARF eran proteínas hidrofílicas e inestables localizadas en el núcleo, con estructuras secundarias que contenían hélices alfa, cadenas extendidas, bucles aleatorios y giros beta, pero carecían de hélices transmembrana (TM-helices) y péptidos señal. El análisis evolutivo dividió las proteínas PeARF en cinco subfamilias (A-E), con alta conservación observada en el orden y número de motivos, dominios, estructura del gen y otras características dentro de cada subfamilia. El análisis del patrón de expresión reveló que 17 genes estaban regulados al alza durante el crecimiento celular y el desarrollo de heterofilia. Este análisis integral proporciona información sobre los mecanismos moleculares de los genes ARF en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés, sirviendo como base para estudios adicionales sobre la vía de señalización de auxinas en .
Descripción
El factor de respuesta a auxinas (ARF) es un factor de transcripción específico de plantas que responde a cambios en los niveles de auxinas, regulando varios procesos biológicos en las plantas, como el desarrollo de flores, la senescencia, la formación de raíces laterales, la respuesta al estrés y la acumulación de metabolitos secundarios. En este estudio, identificamos la familia de genes ARF en Oliv. utilizando análisis bioinformáticos, examinando sus dominios estructurales conservados, la estructura del gen, los productos de expresión y las relaciones evolutivas. Encontramos que los 34 genes estaban distribuidos de manera desigual en 19 cromosomas de . Todas las 56 proteínas PeARF eran proteínas hidrofílicas e inestables localizadas en el núcleo, con estructuras secundarias que contenían hélices alfa, cadenas extendidas, bucles aleatorios y giros beta, pero carecían de hélices transmembrana (TM-helices) y péptidos señal. El análisis evolutivo dividió las proteínas PeARF en cinco subfamilias (A-E), con alta conservación observada en el orden y número de motivos, dominios, estructura del gen y otras características dentro de cada subfamilia. El análisis del patrón de expresión reveló que 17 genes estaban regulados al alza durante el crecimiento celular y el desarrollo de heterofilia. Este análisis integral proporciona información sobre los mecanismos moleculares de los genes ARF en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés, sirviendo como base para estudios adicionales sobre la vía de señalización de auxinas en .