Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes de quinasa WNK en algodón de tierras altas
Autores: Zhang, Qi; Zhang, Caidie; Pan, Zhenyuan; Lin, Hairong; Li, Zhibo; Hou, Xinhe; Liu, Jinshan; Nie, Xinhui; Wu, Yuanlong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes de quinasa WNK en algodón de tierras altas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Quinasas wnk
Respuesta al estrés abiótico
Ritmos circadianos
Estructura génica
Factores de transcripción
Patrones de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
Las quinas (WNK) son una subfamilia de quinasas de proteínas serina/treonina. Los WNK están involucrados en la respuesta de las plantas al estrés abiótico y en los ritmos circadianos. Sin embargo, los miembros de la subfamilia WNK y sus respuestas a los estreses abióticos y bióticos no han sido reportados. En este estudio, se identificaron 26 en . Se identificaron la estructura del gen, los motivos conservados y los marcos de lectura abiertos ascendentes (uORFs) de . Además, se predice que la regulación está influenciada por elementos de acción, como el elemento responsivo al ABA (ABRE), MBS y MYC. Además, se proyecta que factores de transcripción como MIKC_MADS, C2H2, TALE, bZIP, Dof, MYB, bHLH y HD-ZIP desempeñan un papel regulador en . Se evaluaron los patrones de expresión de bajo condiciones normales y estreses bióticos y abióticos, y se encontró que su expresión variaba. Los patrones de expresión de varios fueron inducidos por infiltración con , sugiriendo que varios pueden desempeñar roles importantes en la respuesta del algodón a . Curiosamente, se descubrió un sesgo de expresión homeóloga dentro del en algodón de tierras altas. El sesgo de expresión homeóloga dentro proporciona un marco para ayudar a investigadores y criadores a desarrollar estrategias para mejorar los rasgos del algodón manipulando homeólogos individuales o múltiples.
Descripción
Las quinas (WNK) son una subfamilia de quinasas de proteínas serina/treonina. Los WNK están involucrados en la respuesta de las plantas al estrés abiótico y en los ritmos circadianos. Sin embargo, los miembros de la subfamilia WNK y sus respuestas a los estreses abióticos y bióticos no han sido reportados. En este estudio, se identificaron 26 en . Se identificaron la estructura del gen, los motivos conservados y los marcos de lectura abiertos ascendentes (uORFs) de . Además, se predice que la regulación está influenciada por elementos de acción, como el elemento responsivo al ABA (ABRE), MBS y MYC. Además, se proyecta que factores de transcripción como MIKC_MADS, C2H2, TALE, bZIP, Dof, MYB, bHLH y HD-ZIP desempeñan un papel regulador en . Se evaluaron los patrones de expresión de bajo condiciones normales y estreses bióticos y abióticos, y se encontró que su expresión variaba. Los patrones de expresión de varios fueron inducidos por infiltración con , sugiriendo que varios pueden desempeñar roles importantes en la respuesta del algodón a . Curiosamente, se descubrió un sesgo de expresión homeóloga dentro del en algodón de tierras altas. El sesgo de expresión homeóloga dentro proporciona un marco para ayudar a investigadores y criadores a desarrollar estrategias para mejorar los rasgos del algodón manipulando homeólogos individuales o múltiples.