Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes de factores de transcripción en el manglar
Autores: Pradhan, Seema; Shyamli, P Sushree; Suranjika, Sandhya; Parida, Ajay
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes de factores de transcripción en el manglar
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Sequía
Estrés por salinidad
Estrés abiótico
Halófitas
Familia de genes de factores de transcripción
Elementos cis-regulatorios
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 36
Citaciones: Sin citaciones
La sequía y el estrés por salinidad se han convertido en los principales factores de pérdida de rendimiento de los cultivos en los últimos años. Las condiciones climáticas que cambian drásticamente solo añadirán a los efectos adversos de tales estreses abióticos en el futuro. Por lo tanto, es necesario llevar a cabo una extensa investigación para dilucidar los mecanismos moleculares que regulan la respuesta de las plantas al estrés abiótico. Los halófitos son plantas que pueden crecer en condiciones de alta salinidad y son naturalmente resistentes a una serie de estreses abióticos. es uno de esos halófitos, que crece en regiones tropicales del mundo en áreas de alta salinidad. En este estudio, hemos analizado el papel de la familia de genes de factores de transcripción en respuesta al estrés abiótico, ya que se ha informado que varios factores de transcripción tienen un papel definido en la manifestación del estrés. Identificamos 185 genes a nivel genómico en y los clasificamos según la presencia de motivos conservados en las secuencias de proteínas. Los elementos cis-reguladores (CREs) presentes en la región promotora de estos genes fueron analizados para identificar elementos de respuesta al estrés. La homología comparativa con genes de otras plantas proporcionó una visión de los cambios evolutivos en los genes. El análisis de expresión in silico reveló 34 genes que fueron regulados diferencialmente en las hojas y tejido de raíz de sometidos a estrés por sequía y salinidad. Este estudio es el primer informe de la familia de genes en el genoma y ayudará en la selección de candidatos para una caracterización funcional adicional.
Descripción
La sequía y el estrés por salinidad se han convertido en los principales factores de pérdida de rendimiento de los cultivos en los últimos años. Las condiciones climáticas que cambian drásticamente solo añadirán a los efectos adversos de tales estreses abióticos en el futuro. Por lo tanto, es necesario llevar a cabo una extensa investigación para dilucidar los mecanismos moleculares que regulan la respuesta de las plantas al estrés abiótico. Los halófitos son plantas que pueden crecer en condiciones de alta salinidad y son naturalmente resistentes a una serie de estreses abióticos. es uno de esos halófitos, que crece en regiones tropicales del mundo en áreas de alta salinidad. En este estudio, hemos analizado el papel de la familia de genes de factores de transcripción en respuesta al estrés abiótico, ya que se ha informado que varios factores de transcripción tienen un papel definido en la manifestación del estrés. Identificamos 185 genes a nivel genómico en y los clasificamos según la presencia de motivos conservados en las secuencias de proteínas. Los elementos cis-reguladores (CREs) presentes en la región promotora de estos genes fueron analizados para identificar elementos de respuesta al estrés. La homología comparativa con genes de otras plantas proporcionó una visión de los cambios evolutivos en los genes. El análisis de expresión in silico reveló 34 genes que fueron regulados diferencialmente en las hojas y tejido de raíz de sometidos a estrés por sequía y salinidad. Este estudio es el primer informe de la familia de genes en el genoma y ayudará en la selección de candidatos para una caracterización funcional adicional.