Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes bajo estrés abiótico en arroz (L.)
Autores: Cen, Qiwen; Kang, Lihua; Zhou, Danni; Zhang, Xian; Tian, Quanxiang; Zhang, Xiaoqin; Mou, Wangshu; Dang, Cong; Fang, Yunxia; Xue, Dawei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes bajo estrés abiótico en arroz (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Regulador
Condensación cromosómica
Familia de genes
Relación filogenética
Duplicación génica
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
En plantas, se han identificado los roles esenciales desempeñados por el regulador de la condensación cromosómica 1 (RCC1) en diversos procesos biológicos, incluyendo la respuesta al UV-B (radiación ultravioleta-B), la transducción de señales hormonales, la tolerancia al frío y la plasticidad fenotípica. No se ha realizado un estudio exhaustivo sobre la evolución y función de la familia de genes en arroz. Por lo tanto, se requiere un análisis a nivel genómico de esta familia de genes. En este estudio, se identificaron un total de 26 distribuidos de manera desigual en 10 cromosomas en arroz. Basándose en su relación filogenética y composición de secuencias, la familia OsRCC1 podría clasificarse en seis grupos. Los miembros dentro del mismo grupo comparten una estructura génica similar y una composición de motivos/dominios proteicos. El análisis de duplicación génica reveló que la duplicación segmentaria podría ser la principal contribuyente a la expansión de la familia de genes en arroz. Varios elementos cis-reguladores (CREs) relevantes para la luz, el ácido abscísico (ABA) y el metil jasmonato (MeJA) son abundantes en los promotores de . Un gran número de sitios diana de microARN (miARN) estaban presentes en ARNm. Además, utilizamos datos de microarreglos génicos y qRT-PCR para analizar la expresión de genes durante varias etapas de desarrollo y bajo condiciones de estrés abiótico. se encontraron altamente expresados en paniculas y semillas, y la mayoría fueron diferencialmente expresados bajo estreses abióticos. En conjunto, nuestro estudio proporciona una caracterización sistemática de OsRCC1s y explora preliminarmente su diversidad, así como sus funciones biológicas. La evidencia demuestra que OsRCC1s pueden desempeñar roles vitales tanto en el desarrollo como en la respuesta al estrés abiótico. Los resultados presentados aquí sientan las bases para investigar más a fondo las funciones de OsRCC1s.
Descripción
En plantas, se han identificado los roles esenciales desempeñados por el regulador de la condensación cromosómica 1 (RCC1) en diversos procesos biológicos, incluyendo la respuesta al UV-B (radiación ultravioleta-B), la transducción de señales hormonales, la tolerancia al frío y la plasticidad fenotípica. No se ha realizado un estudio exhaustivo sobre la evolución y función de la familia de genes en arroz. Por lo tanto, se requiere un análisis a nivel genómico de esta familia de genes. En este estudio, se identificaron un total de 26 distribuidos de manera desigual en 10 cromosomas en arroz. Basándose en su relación filogenética y composición de secuencias, la familia OsRCC1 podría clasificarse en seis grupos. Los miembros dentro del mismo grupo comparten una estructura génica similar y una composición de motivos/dominios proteicos. El análisis de duplicación génica reveló que la duplicación segmentaria podría ser la principal contribuyente a la expansión de la familia de genes en arroz. Varios elementos cis-reguladores (CREs) relevantes para la luz, el ácido abscísico (ABA) y el metil jasmonato (MeJA) son abundantes en los promotores de . Un gran número de sitios diana de microARN (miARN) estaban presentes en ARNm. Además, utilizamos datos de microarreglos génicos y qRT-PCR para analizar la expresión de genes durante varias etapas de desarrollo y bajo condiciones de estrés abiótico. se encontraron altamente expresados en paniculas y semillas, y la mayoría fueron diferencialmente expresados bajo estreses abióticos. En conjunto, nuestro estudio proporciona una caracterización sistemática de OsRCC1s y explora preliminarmente su diversidad, así como sus funciones biológicas. La evidencia demuestra que OsRCC1s pueden desempeñar roles vitales tanto en el desarrollo como en la respuesta al estrés abiótico. Los resultados presentados aquí sientan las bases para investigar más a fondo las funciones de OsRCC1s.