El algodón es un cultivo de fibra natural importante. La familia de genes es un miembro de la superfamilia de factores de transcripción bZIP, que juega un papel importante en la resistencia de las plantas a los estreses ambientales. En este artículo, se analizó la familia de genes de cuatro especies de algodón a nivel genómico, y se clonó el gen clave para la verificación funcional. Se identificaron un total de 113 genes en las cuatro especies de algodón, y la familia fue relativamente conservada durante la evolución del algodón. El mapeo de cromosomas y el análisis colineal indicaron que la replicación de fragmentos fue el principal modo de expansión de la familia de genes durante la evolución. El análisis de elementos mostró que había muchos elementos relacionados con la respuesta a la luz, la respuesta hormonal y la respuesta al estrés abiótico en los promotores de los genes. El análisis del transcriptoma y la qRT-PCR de los genes de la familia en el algodón de tierras altas mostró que los genes de la familia respondieron al estrés por sal y al estrés por sequía. La proteína GhRF2-32 se localizó en el núcleo celular. El silenciamiento del gen mostró menos marchitez en las hojas y un aumento en la capacidad antioxidante total bajo estrés por sequía y sal, disminuyó el contenido de malondialdehído y aumentó la tolerancia a la sequía y a la sal. Este estudio reveló la diversidad evolutiva y funcional de la familia de genes, lo que sentó las bases para el estudio posterior de los genes resistentes al estrés en el algodón.