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Identificación, caracterización y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes en L

Autores: Chen, Lide; Ge, Dapeng; Ren, Yuan; Wang, Yuying; Yan, Ming; Zhao, Xueqing; Yuan, Zhaohe

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación, caracterización y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes en L


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Vía de ubiquitinación
Plantas
Familia de proteínas U-box
Genes de granada
Secuenciación de genoma completo
Familia génica

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 27

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La vía de ubiquitinación es esencial para varias fases del desarrollo en las plantas, y la familia de proteínas U-box de ligasas de ubiquitina desempeña un papel importante en este proceso. Sin embargo, se sabe poco sobre los genes de la granada. En esta investigación, se identificó la familia de genes de la granada utilizando datos de secuenciación de genoma completo. Identificamos un total de 56 miembros de la familia de la granada basados en el dominio U-box, y fueron clasificados en cuatro grupos. También se investigaron la localización cromosómica, el análisis filogenético, la distribución de motivos, las duplicaciones génicas, los elementos cis-actuantes y el perfil de expresión. Los genes estaban distribuidos de manera desigual entre los ocho cromosomas de la granada, y se identificaron genes duplicados colineales entre el genoma y el genoma. Además, el análisis de expresión génica reveló que la expresión de genes en la granada fue inducida por factores de estrés abiótico. En conjunto, nuestros hallazgos proporcionan información sobre la familia de genes y ayudarán a comprender la divergencia funcional de genes en L.

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