Identificación, caracterización y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes en L
Autores: Chen, Lide; Ge, Dapeng; Ren, Yuan; Wang, Yuying; Yan, Ming; Zhao, Xueqing; Yuan, Zhaohe
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación, caracterización y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes en L
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Vía de ubiquitinación
Plantas
Familia de proteínas U-box
Genes de granada
Secuenciación de genoma completo
Familia génica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 27
Citaciones: Sin citaciones
La vía de ubiquitinación es esencial para varias fases del desarrollo en las plantas, y la familia de proteínas U-box de ligasas de ubiquitina desempeña un papel importante en este proceso. Sin embargo, se sabe poco sobre los genes de la granada. En esta investigación, se identificó la familia de genes de la granada utilizando datos de secuenciación de genoma completo. Identificamos un total de 56 miembros de la familia de la granada basados en el dominio U-box, y fueron clasificados en cuatro grupos. También se investigaron la localización cromosómica, el análisis filogenético, la distribución de motivos, las duplicaciones génicas, los elementos cis-actuantes y el perfil de expresión. Los genes estaban distribuidos de manera desigual entre los ocho cromosomas de la granada, y se identificaron genes duplicados colineales entre el genoma y el genoma. Además, el análisis de expresión génica reveló que la expresión de genes en la granada fue inducida por factores de estrés abiótico. En conjunto, nuestros hallazgos proporcionan información sobre la familia de genes y ayudarán a comprender la divergencia funcional de genes en L.
Descripción
La vía de ubiquitinación es esencial para varias fases del desarrollo en las plantas, y la familia de proteínas U-box de ligasas de ubiquitina desempeña un papel importante en este proceso. Sin embargo, se sabe poco sobre los genes de la granada. En esta investigación, se identificó la familia de genes de la granada utilizando datos de secuenciación de genoma completo. Identificamos un total de 56 miembros de la familia de la granada basados en el dominio U-box, y fueron clasificados en cuatro grupos. También se investigaron la localización cromosómica, el análisis filogenético, la distribución de motivos, las duplicaciones génicas, los elementos cis-actuantes y el perfil de expresión. Los genes estaban distribuidos de manera desigual entre los ocho cromosomas de la granada, y se identificaron genes duplicados colineales entre el genoma y el genoma. Además, el análisis de expresión génica reveló que la expresión de genes en la granada fue inducida por factores de estrés abiótico. En conjunto, nuestros hallazgos proporcionan información sobre la familia de genes y ayudarán a comprender la divergencia funcional de genes en L.