Los factores de transcripción bHLH (hélice básica-bucle-hélice) funcionan como reguladores cruciales en numerosos procesos biológicos, incluyendo las respuestas al estrés abiótico y el desarrollo de las plantas. Según nuestro análisis de RNA-seq de plántulas de tomate bajo estrés salino, encontramos que, aunque la familia de genes bHLH en tomate ha sido estudiada, todavía hay muchos genes bHLH de tomate que no han sido identificados y nombrados, lo que dificultará el estudio posterior. En total, se identificaron 195 que estaban distribuidos de manera desigual en 12 cromosomas y se clasificaron en 27 subfamilias según sus características moleculares. La colinealidad entre SlbHLHs y ortólogos interrelacionados de 10 plantas reveló además perspectivas evolutivas. Las investigaciones de elementos cis en promotores sugirieron además los roles potenciales de estos en el desarrollo del tomate y las respuestas al estrés. Un total de 30 fueron definidos como los genes diferencialmente expresados en respuesta al estrés salino mediante RNA-seq. Los perfiles de expresión de los seleccionados fueron inducidos de manera variable y notable por múltiples estreses abióticos y tratamientos hormonales. Estos resultados proporcionan información valiosa para comprender mejor la importancia y complejidad de la familia de factores de transcripción bHLH, y sientan las bases para explorar más a fondo las funciones y posibles mecanismos regulatorios de los miembros de SlbHLH en la tolerancia al estrés abiótico, lo que será significativo para el estudio de la resistencia al estrés en el tomate y la productividad agrícola.