Análisis del genoma completo de la familia de factores de transcripción CPP en plantas en peligro de extinción y su respuesta a la adversidad
Autores: Liu, Ronglin; Feng, Yizhuo; Li, Qingyan; Wu, Hua; Guo, Shengzhou; Li, Junnan; Liu, Xiaomin; Zhang, Yanlin; Tang, Xinghao; Cao, Shijiang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Análisis del genoma completo de la familia de factores de transcripción CPP en plantas en peligro de extinción y su respuesta a la adversidad
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia de genes
Genes de factores de transcripción
Dominio CRC
Plantas leñosas
Análisis filogenético
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes comprende genes de factores de transcripción que contienen un dominio CRC conservado, que está principalmente involucrado en el desarrollo y la evolución de las plantas. Aunque los genes han sido ampliamente estudiados en muchas plantas, se sabe poco sobre ellos en plantas leñosas, especialmente en las especies en peligro de extinción (Hemsl.). En el genoma identificamos 11 genes distribuidos en cuatro cromosomas, con grandes diferencias en el número de aminoácidos. Codifican tanto proteínas ácidas como alcalinas. Un análisis filogenético mostró que estos genes se pueden dividir en tres subfamilias, A, B y C, que contienen siete, dos y dos genes, respectivamente. A través de un análisis de colinealidad interespecífica, identificamos genes homólogos. Un análisis de elementos cis-actuantes del promotor reveló que los PbCPPs contienen una variedad de elementos que responden a hormonas vegetales, señales de estrés y luz, y desempeñan un papel en el crecimiento y desarrollo, y la mayoría de los genes (excepto algunos) contienen elementos de sitios de unión MYB que regulan las respuestas al estrés inducido por sequía, lo que indica que desempeñan un papel importante en la resistencia a la sequía de las plantas. Un análisis de expresión mostró que la expresión era alta en las raíces y los tallos y más baja en las hojas, mientras que la expresión de la mayoría de los otros genes era baja en las raíces, tallos y hojas. Además, se detectaron seis genes representativos utilizando qRT-PCR. Los resultados muestran diferencias significativas en la expresión de los genes bajo condiciones de estrés abiótico (sequía, frío y sal), lo que indica que desempeñan un papel importante en las respuestas al estrés. Este estudio verificó preliminarmente el papel de la familia de genes en diferentes respuestas al estrés abiótico, lo que es de gran importancia para comprender su mecanismo en el crecimiento y desarrollo de las plantas y la adaptación al estrés.
Descripción
La familia de genes comprende genes de factores de transcripción que contienen un dominio CRC conservado, que está principalmente involucrado en el desarrollo y la evolución de las plantas. Aunque los genes han sido ampliamente estudiados en muchas plantas, se sabe poco sobre ellos en plantas leñosas, especialmente en las especies en peligro de extinción (Hemsl.). En el genoma identificamos 11 genes distribuidos en cuatro cromosomas, con grandes diferencias en el número de aminoácidos. Codifican tanto proteínas ácidas como alcalinas. Un análisis filogenético mostró que estos genes se pueden dividir en tres subfamilias, A, B y C, que contienen siete, dos y dos genes, respectivamente. A través de un análisis de colinealidad interespecífica, identificamos genes homólogos. Un análisis de elementos cis-actuantes del promotor reveló que los PbCPPs contienen una variedad de elementos que responden a hormonas vegetales, señales de estrés y luz, y desempeñan un papel en el crecimiento y desarrollo, y la mayoría de los genes (excepto algunos) contienen elementos de sitios de unión MYB que regulan las respuestas al estrés inducido por sequía, lo que indica que desempeñan un papel importante en la resistencia a la sequía de las plantas. Un análisis de expresión mostró que la expresión era alta en las raíces y los tallos y más baja en las hojas, mientras que la expresión de la mayoría de los otros genes era baja en las raíces, tallos y hojas. Además, se detectaron seis genes representativos utilizando qRT-PCR. Los resultados muestran diferencias significativas en la expresión de los genes bajo condiciones de estrés abiótico (sequía, frío y sal), lo que indica que desempeñan un papel importante en las respuestas al estrés. Este estudio verificó preliminarmente el papel de la familia de genes en diferentes respuestas al estrés abiótico, lo que es de gran importancia para comprender su mecanismo en el crecimiento y desarrollo de las plantas y la adaptación al estrés.