Análisis del genoma completo de la familia de genes Aux/IAA: identificación, análisis filogenético y determinación de la respuesta a varias fitohormonas
Autores: Lian, Conglong; Lan, Jinxu; Ma, Rui; Li, Jingjing; Zhang, Fei; Zhang, Bao; Liu, Xiuyu; Chen, Suiqing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis del genoma completo de la familia de genes Aux/IAA: identificación, análisis filogenético y determinación de la respuesta a varias fitohormonas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Planta de medicina herbal tradicional
Folium artemisia argyi
Auxina/ácido indol-3-acético
Familia de genes
Desarrollo de plantas
Respuesta al estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
es una planta de medicina herbal tradicional, y su folium artemisia argyi tiene una gran demanda debido a las aplicaciones de moxibustión a nivel mundial. La familia de genes Auxina/ácido indol-3-acético (Aux/IAA, o IAA) tiene roles críticos en el proceso de respuesta primaria a la auxina, con una amplia participación en el desarrollo de las plantas y en las tensiones, controlando varios rasgos esenciales de las plantas. Sin embargo, la investigación sistemática de la familia de genes Aux/IAA en sigue siendo limitada. En este estudio, se identificaron y caracterizaron de manera integral un total de 61 genes Aux/IAA. El análisis de la estructura genética indicó que 46 proteínas Aux/IAA contienen los cuatro dominios típicos, y 15 proteínas Aux/IAA pertenecen a proteínas IAA no canónicas. La predicción colineal y los análisis de relaciones filogenéticas sugirieron que las proteínas Aux/IAA se agruparon en 13 categorías distintas, y la mayoría de los genes Aux/IAA podrían experimentar pérdida de genes durante el proceso de duplicación en tándem. La investigación de elementos promotores indicó que los promotores Aux/IAA contienen una variedad de elementos de respuesta a hormonas vegetales y de respuesta a estrés. El análisis de predicción de interacción de proteínas demostró que las proteínas AaIAA26/29/7/34 son posiblemente miembros centrales de la interacción de la familia Aux/IAA. El análisis de expresión en raíces y hojas a través de datos de RNA-seq indicó que la expresión de algunos AaIAAs exhibió patrones de expresión específicos de tejido, y algunos AaIAAs estaban involucrados en la regulación de tensiones por sal y salinas-alcalinas. Además, los resultados de RT-qPCR indicaron que los genes AaIAA tienen respuestas diferenciales a la auxina, con patrones de respuesta complejos en respuesta a otras hormonas, lo que indica que Aux/IAA puede desempeñar un papel en la conexión de la auxina y otras vías de señalización hormonal. En general, estos hallazgos arrojan más luz sobre los genes AaIAA y ofrecen un conocimiento fundamental crítico hacia la elucidación de su función durante el crecimiento de las plantas, la respuesta al estrés y la interconexión hormonal de los genes de la familia Aux/IAA en.
Descripción
es una planta de medicina herbal tradicional, y su folium artemisia argyi tiene una gran demanda debido a las aplicaciones de moxibustión a nivel mundial. La familia de genes Auxina/ácido indol-3-acético (Aux/IAA, o IAA) tiene roles críticos en el proceso de respuesta primaria a la auxina, con una amplia participación en el desarrollo de las plantas y en las tensiones, controlando varios rasgos esenciales de las plantas. Sin embargo, la investigación sistemática de la familia de genes Aux/IAA en sigue siendo limitada. En este estudio, se identificaron y caracterizaron de manera integral un total de 61 genes Aux/IAA. El análisis de la estructura genética indicó que 46 proteínas Aux/IAA contienen los cuatro dominios típicos, y 15 proteínas Aux/IAA pertenecen a proteínas IAA no canónicas. La predicción colineal y los análisis de relaciones filogenéticas sugirieron que las proteínas Aux/IAA se agruparon en 13 categorías distintas, y la mayoría de los genes Aux/IAA podrían experimentar pérdida de genes durante el proceso de duplicación en tándem. La investigación de elementos promotores indicó que los promotores Aux/IAA contienen una variedad de elementos de respuesta a hormonas vegetales y de respuesta a estrés. El análisis de predicción de interacción de proteínas demostró que las proteínas AaIAA26/29/7/34 son posiblemente miembros centrales de la interacción de la familia Aux/IAA. El análisis de expresión en raíces y hojas a través de datos de RNA-seq indicó que la expresión de algunos AaIAAs exhibió patrones de expresión específicos de tejido, y algunos AaIAAs estaban involucrados en la regulación de tensiones por sal y salinas-alcalinas. Además, los resultados de RT-qPCR indicaron que los genes AaIAA tienen respuestas diferenciales a la auxina, con patrones de respuesta complejos en respuesta a otras hormonas, lo que indica que Aux/IAA puede desempeñar un papel en la conexión de la auxina y otras vías de señalización hormonal. En general, estos hallazgos arrojan más luz sobre los genes AaIAA y ofrecen un conocimiento fundamental crítico hacia la elucidación de su función durante el crecimiento de las plantas, la respuesta al estrés y la interconexión hormonal de los genes de la familia Aux/IAA en.