Análisis del genoma completo de los genes de polipéptidos inducidos por heridas en y sus dinámicas de expresión durante la infección por nematodos císticos
Autores: Kang, Wenshu; Sun, Zicheng; Xu, Jiayao; Qi, Nawei; Lei, Piao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Análisis del genoma completo de los genes de polipéptidos inducidos por heridas en y sus dinámicas de expresión durante la infección por nematodos císticos
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Planta
Péptidos
Genes
Defensa
Infección
Reguladores
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 36
Citaciones: Sin citaciones
Los pequeños péptidos de plantas son reguladores críticos de varios procesos biológicos, incluido el desarrollo y las respuestas al estrés. Los polipéptidos dentro de la familia DUF3774, conocidos como polipéptidos inducidos por heridas (WIPs), han sido identificados como actores clave en la inmunidad desencadenada por patrones (PTI) y los mecanismos de defensa en . En este estudio, se realizó la identificación a nivel genómico de los genes WIP en , seguida de la corrección y validación de la estructura génica utilizando datos de secuenciación de ARN de segunda generación y de longitud completa. Se identificaron y validaron un total de 31 genes, mapeados en los cromosomas Gm06, Gm12, Gm13 y Gm06_scaffold_301. El análisis filogenético agrupó estos genes en cinco clústeres distintos, con la duplicación en tándem surgiendo como el mecanismo principal para su expansión en el genoma de la soja. El análisis de qRT-PCR reveló cambios dinámicos y significativos en la expresión durante la infección por nematodos císticos de la soja (SCN) en un cultivar de soja susceptible. Notablemente, el 90% de los genes fueron regulados a la baja en la etapa temprana de la infección por SCN (1 dpi), y corroborado aún más por el sistema de reportero pGmWIPs::GUS. Estos hallazgos sugieren que los genes pueden actuar como reguladores en las respuestas de defensa de cultivares de soja susceptibles, proporcionando una base para futuros estudios funcionales.
Descripción
Los pequeños péptidos de plantas son reguladores críticos de varios procesos biológicos, incluido el desarrollo y las respuestas al estrés. Los polipéptidos dentro de la familia DUF3774, conocidos como polipéptidos inducidos por heridas (WIPs), han sido identificados como actores clave en la inmunidad desencadenada por patrones (PTI) y los mecanismos de defensa en . En este estudio, se realizó la identificación a nivel genómico de los genes WIP en , seguida de la corrección y validación de la estructura génica utilizando datos de secuenciación de ARN de segunda generación y de longitud completa. Se identificaron y validaron un total de 31 genes, mapeados en los cromosomas Gm06, Gm12, Gm13 y Gm06_scaffold_301. El análisis filogenético agrupó estos genes en cinco clústeres distintos, con la duplicación en tándem surgiendo como el mecanismo principal para su expansión en el genoma de la soja. El análisis de qRT-PCR reveló cambios dinámicos y significativos en la expresión durante la infección por nematodos císticos de la soja (SCN) en un cultivar de soja susceptible. Notablemente, el 90% de los genes fueron regulados a la baja en la etapa temprana de la infección por SCN (1 dpi), y corroborado aún más por el sistema de reportero pGmWIPs::GUS. Estos hallazgos sugieren que los genes pueden actuar como reguladores en las respuestas de defensa de cultivares de soja susceptibles, proporcionando una base para futuros estudios funcionales.