Análisis completo del genoma de cloroplastos: Pérdida de genes en el límite del IR y evolución monofilética dentro de
Autores: Yan, Kan; Li, Wandi; Sun, Chao; Lu, Xin; Zhou, Xueqiong; Wang, Youyou; Tian, Yongqiang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Análisis completo del genoma de cloroplastos: Pérdida de genes en el límite del IR y evolución monofilética dentro de
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Análisis genómico
Historia evolutiva
Conservación
Genoma de cloroplasto
Relaciones filogenéticas
Marcadores moleculares
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
El análisis genómico es crucial para entender la historia evolutiva, las relaciones filogenéticas y la conservación efectiva de las especies de plantas. es una planta medicinal importante del género, pero su genoma completo de cloroplasto no se ha reportado previamente, limitando los estudios genéticos y los esfuerzos de conservación. En este estudio, ensamblamos y anotamos el genoma completo de cloroplasto utilizando tecnología de secuenciación Illumina y realizamos un análisis de genómica comparativa con 14 especies estrechamente relacionadas para aclarar su posición filogenética dentro de. El genoma de cloroplasto tenía 157,998 pb, mostrando una estructura cuadripartita típica. Los hallazgos clave incluyeron: (1) la pérdida del gen en el límite del IR; (2) la identificación de 60 repeticiones de secuencia simple (SSR) y (3) el descubrimiento de cinco marcadores moleculares candidatos para la identificación a nivel de especie. El análisis filogenético reveló que formó un clado monofilético fuertemente respaldado (100% de soporte bootstrap) con, , y, este clado se originó hace aproximadamente 15.8 millones de años. Este estudio proporciona herramientas moleculares para la identificación precisa y la conservación de y especies relacionadas, sentando las bases para explorar la evolución adaptativa dentro de y avanzar en la investigación de genómica comparativa.
Descripción
El análisis genómico es crucial para entender la historia evolutiva, las relaciones filogenéticas y la conservación efectiva de las especies de plantas. es una planta medicinal importante del género, pero su genoma completo de cloroplasto no se ha reportado previamente, limitando los estudios genéticos y los esfuerzos de conservación. En este estudio, ensamblamos y anotamos el genoma completo de cloroplasto utilizando tecnología de secuenciación Illumina y realizamos un análisis de genómica comparativa con 14 especies estrechamente relacionadas para aclarar su posición filogenética dentro de. El genoma de cloroplasto tenía 157,998 pb, mostrando una estructura cuadripartita típica. Los hallazgos clave incluyeron: (1) la pérdida del gen en el límite del IR; (2) la identificación de 60 repeticiones de secuencia simple (SSR) y (3) el descubrimiento de cinco marcadores moleculares candidatos para la identificación a nivel de especie. El análisis filogenético reveló que formó un clado monofilético fuertemente respaldado (100% de soporte bootstrap) con, , y, este clado se originó hace aproximadamente 15.8 millones de años. Este estudio proporciona herramientas moleculares para la identificación precisa y la conservación de y especies relacionadas, sentando las bases para explorar la evolución adaptativa dentro de y avanzar en la investigación de genómica comparativa.