Análisis del Genoma Completo y Evaluación del Potencial Metabólico de la Cepa 112, un Degradador de Compuestos Aromáticos y Alifáticos
Autores: Frantsuzova, Ekaterina; Bogun, Alexander; Solomentsev, Viktor; Vetrova, Anna; Streletskii, Rostislav; Solyanikova, Inna; Delegan, Yanina
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis del Genoma Completo y Evaluación del Potencial Metabólico de la Cepa 112, un Degradador de Compuestos Aromáticos y Alifáticos
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Aplicación
Cepas
Biotecnologías
Purificación ambiental
Degradadores
Contaminantes
Genoma
Secuencias codificantes
Genes de ARN
Elementos de plásmido
Vías metabólicas
Degradación
Capacidades
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 21
Citaciones: Sin citaciones
La aplicación de cepas en biotecnologías de purificación ambiental como degradadores de contaminantes de diferentes estructuras químicas es un tema de investigación interesante. La cepa 112 (IEGM112) es capaz de utilizar combustible diésel, alcanos y compuestos aromáticos. El objetivo de este trabajo fue estudiar el potencial de 112 como degradador de compuestos aromáticos y alifáticos y analizar su genoma completo en comparación con otras cepas conocidas. El genoma tenía una longitud total de 5.28 Mb y contenía un total de 4861 genes, de los cuales 4799 eran secuencias codificantes (CDS). El genoma contenía un total de 62 genes de ARN, de los cuales 50 eran tARN, tres eran ncARN y nueve eran rARN. La cepa posee elementos plasmídicos con una longitud total de 189,570 nucleótidos (plásmido p1517). La cepa puede utilizar un 10.79 +/- 1.17% de hexadecano y un 16.14 +/- 0.16% de decano durante 3 días de cultivo. En el genoma de la cepa, hemos encontrado vías metabólicas de degradación de alcanos (hidroxilasas de citocromo P450) y de catecol (vías orto y meta). Estos resultados nos ayudarán a acercarnos más al estudio fundamental de los procesos que ocurren en las células de la cepa y a enriquecer nuestro conocimiento sobre las capacidades catabólicas de .
Descripción
La aplicación de cepas en biotecnologías de purificación ambiental como degradadores de contaminantes de diferentes estructuras químicas es un tema de investigación interesante. La cepa 112 (IEGM112) es capaz de utilizar combustible diésel, alcanos y compuestos aromáticos. El objetivo de este trabajo fue estudiar el potencial de 112 como degradador de compuestos aromáticos y alifáticos y analizar su genoma completo en comparación con otras cepas conocidas. El genoma tenía una longitud total de 5.28 Mb y contenía un total de 4861 genes, de los cuales 4799 eran secuencias codificantes (CDS). El genoma contenía un total de 62 genes de ARN, de los cuales 50 eran tARN, tres eran ncARN y nueve eran rARN. La cepa posee elementos plasmídicos con una longitud total de 189,570 nucleótidos (plásmido p1517). La cepa puede utilizar un 10.79 +/- 1.17% de hexadecano y un 16.14 +/- 0.16% de decano durante 3 días de cultivo. En el genoma de la cepa, hemos encontrado vías metabólicas de degradación de alcanos (hidroxilasas de citocromo P450) y de catecol (vías orto y meta). Estos resultados nos ayudarán a acercarnos más al estudio fundamental de los procesos que ocurren en las células de la cepa y a enriquecer nuestro conocimiento sobre las capacidades catabólicas de .