Análisis genéticos de la longevidad de las semillas en L. en condiciones de almacenamiento en frío
Autores: Arif, Mian Abdur Rehman; Tripodi, Pasquale; Waheed, Muhammad Qandeel; Afzal, Irfan; Pistrick, Sibylle; Schütze, Gudrun; Börner, Andreas
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis genéticos de la longevidad de las semillas en L. en condiciones de almacenamiento en frío
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Longevidad de semillas
Sistema de gestión de bancos de genes
Accesiones
Base genética
Polimorfismo de un solo nucleótido
Genes candidatos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La longevidad de las semillas es el rasgo más importante en el sistema de gestión de bancos de germoplasma. Ninguna semilla puede permanecer viable indefinidamente. Hay 1241 accesiones de L. disponibles en el banco de germoplasma ex situ federal alemán en IPK Gatersleben. () es la especie más económicamente importante del género. Hasta ahora, no hay ningún informe que haya abordado la base genética de la longevidad de las semillas. Aquí, convocamos un total de 1152 accesiones que fueron depositadas en Gatersleben durante más de cuarenta años (desde 1976 hasta 2017) y evaluamos su longevidad analizando el porcentaje de germinación estándar después de 5-40 años de almacenamiento a -15/-18 grados C. Estos datos se utilizaron para determinar las causas genéticas de la longevidad de las semillas, junto con 23,462 marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) que cubren todos los 12 cromosomas. Utilizando el enfoque de mapeo de asociación, identificamos un total de 224 asociaciones de marcadores y rasgos (MTAs) (34, 25, 31, 35, 39, 7, 21 y 32 MTAs después de intervalos de almacenamiento de 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 y 40 años) en todos los cromosomas. Se identificaron varios genes candidatos utilizando el análisis blast de SNPs, y se discuten estos genes candidatos.
Descripción
La longevidad de las semillas es el rasgo más importante en el sistema de gestión de bancos de germoplasma. Ninguna semilla puede permanecer viable indefinidamente. Hay 1241 accesiones de L. disponibles en el banco de germoplasma ex situ federal alemán en IPK Gatersleben. () es la especie más económicamente importante del género. Hasta ahora, no hay ningún informe que haya abordado la base genética de la longevidad de las semillas. Aquí, convocamos un total de 1152 accesiones que fueron depositadas en Gatersleben durante más de cuarenta años (desde 1976 hasta 2017) y evaluamos su longevidad analizando el porcentaje de germinación estándar después de 5-40 años de almacenamiento a -15/-18 grados C. Estos datos se utilizaron para determinar las causas genéticas de la longevidad de las semillas, junto con 23,462 marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) que cubren todos los 12 cromosomas. Utilizando el enfoque de mapeo de asociación, identificamos un total de 224 asociaciones de marcadores y rasgos (MTAs) (34, 25, 31, 35, 39, 7, 21 y 32 MTAs después de intervalos de almacenamiento de 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35 y 40 años) en todos los cromosomas. Se identificaron varios genes candidatos utilizando el análisis blast de SNPs, y se discuten estos genes candidatos.