La raíz es el órgano responsable de la absorción de agua y, por lo tanto, desempeña un papel muy importante en la tolerancia a la sequía. Los objetivos del presente trabajo fueron caracterizar nueve rasgos de la arquitectura del sistema de raíces (RSA, por sus siglas en inglés) y el peso seco del brote (W) de doce genotipos de spp. bajo estrés hídrico y establecer la relación entre los rasgos de fenotipado de RSA y SSRs. Se han utilizado dos medios de cultivo, uno estándar (SM) y otro (PEG) para inducir estrés hídrico. En el medio SM, tuvo los valores más altos de W y todos los rasgos de RSA, excepto el diámetro medio de las raíces seminales, seguido por . En el medio PEG, la longitud de la raíz aumentó en , disminuyó en y se mantuvo igual en . Se realizó un análisis jerárquico de conglomerados bidireccional a partir de 117 SSRs polimórficos y los rasgos de la RSA de los genotipos de spp. Los genotipos se separaron en tres grupos correspondientes a cada especie. En la segunda vía del agrupamiento jerárquico se observaron asociaciones entre cinco variables de RSA y marcadores SSR, lo cual podría ser útil en la búsqueda de genes o QTLs relacionados con los caracteres de RSA.