Análisis de Asociación del Genoma Completo del pH Muscular en la Población de Recursos F de Ovejas Texel x Ovejas Altay
Autores: Zhao, Yilong; He, Sangang; Huang, Jinfeng; Liu, Mingjun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis de Asociación del Genoma Completo del pH Muscular en la Población de Recursos F de Ovejas Texel x Ovejas Altay
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Rasgos de calidad de la carne
Valores de pH
Genotipado
Genes candidatos
Análisis de asociación a nivel genómico
Análisis bioinformáticos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
El pH fue uno de los rasgos importantes de calidad de la carne, que era un factor importante que afectaba la vida útil y la calidad de la carne en la producción cárnica. Con el fin de encontrar una manera de extender la vida útil, se determinaron los valores de pH (pH, pH, pH y pH) de los músculos longissimus dorsi en individuos F de 462 ovejas Texel x ovejas Altay, se realizó genotipificación utilizando el BeadChip Illumina Ovine SNP 600 K y tecnología de resecuenciación del genoma completo, se utilizó un análisis de asociación a nivel genómico (GWAS) para filtrar los genes candidatos y marcadores moleculares para los valores de pH relacionados con los rasgos de calidad de la carne de cordero, y los efectos de la estratificación poblacional se detectaron mediante gráficos Q-Q. Los resultados mostraron que el análisis de estratificación poblacional del pH no encontró sesgo sistémico significativo, y no hubo un efecto obvio de estratificación poblacional. Los resultados del análisis de asociación mostraron que 28 SNPs se asociaron significativamente con el pH alcanzando el nivel de significancia genómica. El gen candidato asociado con el pH fue identificado como el gen mediante anotación genética y una búsqueda en la literatura. Los genes candidatos relacionados con el pH fueron, y genes. Los genes candidatos relacionados con el pH fueron y genes. Los genes candidatos relacionados con el pH fueron y genes. Análisis bioinformáticos adicionales mostraron 24 términos de ontología genética y cinco vías de señalización que estaban significativamente enriquecidas.
Descripción
El pH fue uno de los rasgos importantes de calidad de la carne, que era un factor importante que afectaba la vida útil y la calidad de la carne en la producción cárnica. Con el fin de encontrar una manera de extender la vida útil, se determinaron los valores de pH (pH, pH, pH y pH) de los músculos longissimus dorsi en individuos F de 462 ovejas Texel x ovejas Altay, se realizó genotipificación utilizando el BeadChip Illumina Ovine SNP 600 K y tecnología de resecuenciación del genoma completo, se utilizó un análisis de asociación a nivel genómico (GWAS) para filtrar los genes candidatos y marcadores moleculares para los valores de pH relacionados con los rasgos de calidad de la carne de cordero, y los efectos de la estratificación poblacional se detectaron mediante gráficos Q-Q. Los resultados mostraron que el análisis de estratificación poblacional del pH no encontró sesgo sistémico significativo, y no hubo un efecto obvio de estratificación poblacional. Los resultados del análisis de asociación mostraron que 28 SNPs se asociaron significativamente con el pH alcanzando el nivel de significancia genómica. El gen candidato asociado con el pH fue identificado como el gen mediante anotación genética y una búsqueda en la literatura. Los genes candidatos relacionados con el pH fueron, y genes. Los genes candidatos relacionados con el pH fueron y genes. Los genes candidatos relacionados con el pH fueron y genes. Análisis bioinformáticos adicionales mostraron 24 términos de ontología genética y cinco vías de señalización que estaban significativamente enriquecidas.