Huanglongbing (HLB), causado principalmente por Liberibacter (CLas), es una enfermedad devastadora que amenaza la producción de cítricos en todo el mundo, llevando a la moteado de las hojas, deformación de los frutos y pérdidas significativas en el rendimiento. Este estudio generó un análisis integral de la red de coexpresión utilizando datos de RNA-seq de 17 conjuntos de datos públicos. Se aplicó el análisis de red de coexpresión de genes ponderados (WGCNA) para identificar módulos de genes asociados con especies de cítricos, tipos de tejidos y días post-infección (DPI). Estos módulos revelaron un enriquecimiento significativo en vías biológicas relacionadas con respuestas al estrés, reprogramación metabólica, síntesis de proteínas ribosómicas, función de cloroplastos y plastidios, arquitectura celular y transporte intracelular. Los resultados ofrecen un marco molecular para entender la patogénesis del HLB y la respuesta del huésped. Al elucidar funciones específicas de los módulos y su correlación con respuestas específicas de especies y tejidos, este estudio proporciona una base sólida para identificar objetivos genéticos clave. Estos conocimientos facilitan programas de cría enfocados en desarrollar cultivares de cítricos tolerantes al HLB, contribuyendo a la sostenibilidad y resiliencia a largo plazo de la producción global de cítricos.