Disección genética de diversos patrones de tegumento de semillas en frijol de ojo negro a través de un enfoque integral de GWAS
Autores: Xiong, Haizheng; Chen, Yilin; Ravelombola, Waltram; Mou, Beiquan; Sun, Xiaolun; Zhang, Qingyang; Xiao, Yiting; Tian, Yang; Luo, Qun; Alatawi, Ibtisam; Chiwina, Kenani Edward; Alkabkabi, Hanan Mohammedsaeed; Shi, Ainong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Disección genética de diversos patrones de tegumento de semillas en frijol de ojo negro a través de un enfoque integral de GWAS
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Determinantes genéticos
Color de la cubierta de la semilla
Variaciones en el patrón
Polimorfismos de un solo nucleótido
Genes candidatos
Programas de mejoramiento
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Este estudio investiga los determinantes genéticos de las variaciones en el color y patrón de la cubierta de semillas en el frijol de ojo negro, empleando un enfoque de asociación a nivel genómico. Al analizar un panel de mapeo de 296 variedades de frijol de ojo negro con 110,000 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), nos centramos en ocho patrones de cubierta únicos: (1) Semilla roja y (2) Semilla crema; (3) Semilla blanca y (4) Semilla marrón/amarillo; (5) Rosa, (6) Negra, (7) Ojo marrón y (8) Holstein rojo/marrón. A través de seis modelos de GWAS (GLM, SRM, MLM, MLMM, FarmCPU de GAPIT3 y TASSEL5), se identificaron 13 marcadores SNP significativos que llevaron al descubrimiento de 23 genes candidatos. Entre estos, cuatro genes específicos pueden desempeñar un papel directo en la determinación del pigmento de la cubierta de la semilla. Estos hallazgos establecen una base fundamental para futuros programas de mejoramiento dirigidos a crear variedades de frijol de ojo negro alineadas con las preferencias de los consumidores y los requisitos del mercado.
Descripción
Este estudio investiga los determinantes genéticos de las variaciones en el color y patrón de la cubierta de semillas en el frijol de ojo negro, empleando un enfoque de asociación a nivel genómico. Al analizar un panel de mapeo de 296 variedades de frijol de ojo negro con 110,000 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs), nos centramos en ocho patrones de cubierta únicos: (1) Semilla roja y (2) Semilla crema; (3) Semilla blanca y (4) Semilla marrón/amarillo; (5) Rosa, (6) Negra, (7) Ojo marrón y (8) Holstein rojo/marrón. A través de seis modelos de GWAS (GLM, SRM, MLM, MLMM, FarmCPU de GAPIT3 y TASSEL5), se identificaron 13 marcadores SNP significativos que llevaron al descubrimiento de 23 genes candidatos. Entre estos, cuatro genes específicos pueden desempeñar un papel directo en la determinación del pigmento de la cubierta de la semilla. Estos hallazgos establecen una base fundamental para futuros programas de mejoramiento dirigidos a crear variedades de frijol de ojo negro alineadas con las preferencias de los consumidores y los requisitos del mercado.