Debido al alto rendimiento cárnico y al rico contenido nutricional, el perca de jade se ha convertido en una especie de acuicultura comercial importante en China. El perca de jade tiene una tasa de crecimiento lenta, tardando de 3 a 4 años en alcanzar la madurez sexual, y casi no hay diferencia en el tamaño corporal entre machos y hembras. Sin embargo, el estudio de su desarrollo gonadal y la regulación de la reproducción aún está en blanco, lo que limita el aumento del rendimiento. En este trabajo, se identificaron por primera vez los transcriptomas gonadales de machos y hembras juveniles. Se anotaron con éxito un total de 107,060 unigenes. Al comparar los transcriptomas gonadales de machos y hembras, se identificaron un total de 23,849 genes expresados diferencialmente (DEGs), de los cuales 9,517 estaban regulados a la baja y 14,332 estaban regulados al alza en el testículo. Además, se identificó un gran número de DEGs involucrados en la diferenciación sexual, el desarrollo y la diferenciación gonadal y la gametogénesis, y se verificaron más a fondo los patrones de expresión diferencial de algunos genes utilizando PCR cuantitativa en tiempo real. Los resultados de este estudio proporcionarán un recurso valioso para futuros estudios sobre la determinación del sexo y el desarrollo gonadal del perca de jade.