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Análisis metagenómico basado en el gen 16S rRNA de bacterias del suelo de la rizosfera en campos de cultivo de arroz de Arkansas

Autores: Oliveira, Cássia; Shakiba, Ehsan; North, Dustin; McGraw, Madison; Ballard, Ethan; Barrett-D"Amico, Marissa; Glazko, Galina; Rahmatallah, Yasir

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico
2022

Análisis metagenómico basado en el gen 16S rRNA de bacterias del suelo de la rizosfera en campos de cultivo de arroz de Arkansas


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Microbios
Raíces de plantas
Microorganismos del suelo
Rotación de cultivos
Métodos de cultivo del suelo
Diversidad bacteriana

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 23

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El rizomicrobioma está compuesto por microbios que viven en asociación con las raíces de las plantas. Desde el ciclo de nutrientes hasta la fijación de carbono, los microorganismos del suelo han proporcionado una base sólida para que los ecosistemas naturales y agrícolas funcionen. La relación entre las raíces de las plantas y los microorganismos del suelo es especialmente relevante en alimentos básicos como el arroz (L.), ya que las diversas propiedades de estos microbios pueden influir en el rendimiento de los cultivos y la salud de las plantas, afectando así una parte importante del suministro de alimentos para una población mundial en constante crecimiento. En este estudio, utilizamos un análisis metagenómico basado en el gen 16S ARNr para investigar el impacto de la rotación de cultivos y los métodos de cultivo del suelo (sin labranza o labranza) en la diversidad y composición bacteriana de la rizosfera en ocho campos de cultivo en Arkansas. El secuenciamiento Illumina MiSeq reveló 56 Filos, con cuatro Filos principales: Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria y Bacteroidetes. Las comunidades microbianas del suelo en las muestras estudiadas fueron filogenéticamente diversas pero con una estructura comunitaria estable. La rotación de cultivos y la labranza no afectaron significativamente la diversidad bacteriana.

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