Análisis filogenético y de expresión de la familia de genes SBP-Box para mejorar la resiliencia ambiental y la productividad en cv
Autores: Gao, Yusen; Wen, Yingxin; Lin, Qinmin; Feng, Yizhuo; Shi, Xinying; Xiao, Siyao; Tumukunde, Elisabeth; Zheng, Kehui; Cao, Shijiang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Análisis filogenético y de expresión de la familia de genes SBP-Box para mejorar la resiliencia ambiental y la productividad en cv
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Té tieguanyin
Factor de transcripción sbp-box
Desarrollo de plantas
árbol filogenético
Arquitectura genética
Respuestas al estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
El té Tieguanyin, un famoso té oolong, es uno de los diez tés más conocidos en China. La familia de factores de transcripción de proteínas de unión al promotor SBP-box, ampliamente presente en las plantas, desempeña un papel crucial en el desarrollo, crecimiento y respuestas al estrés de las plantas. En este estudio, identificamos y analizamos 22 genes a nivel del genoma. Estos genes estaban distribuidos de manera desigual en 11 cromosomas. Usando L. como organismos modelo, construimos un árbol filogenético para clasificar estos genes en seis subfamilias distintas. El análisis de colinealidad reveló 20 pares de genes homólogos entre y, 21 pares entre y, y 14 pares entre y. El análisis de elementos cis-actuantes indicó que los elementos responsivos a la luz eran los más abundantes entre los genes. Los análisis de motivos de proteínas, dominios y arquitectura de genes demostraron que los miembros del mismo subgrupo compartían estructuras similares de exones e intrones y disposiciones de motivos. Además, evaluamos los perfiles de expresión de nueve genes bajo luz, sombra y estrés por frío utilizando análisis de qRT-PCR. Notablemente, y fueron significativamente regulados al alza bajo los tres tipos de estrés. Este estudio proporciona conocimientos fundamentales sobre la familia de genes y ofrece una nueva perspectiva sobre los mecanismos de las respuestas al estrés mediadas por factores de transcripción SBP, así como la adaptación del té Tieguanyin a las variaciones ambientales.
Descripción
El té Tieguanyin, un famoso té oolong, es uno de los diez tés más conocidos en China. La familia de factores de transcripción de proteínas de unión al promotor SBP-box, ampliamente presente en las plantas, desempeña un papel crucial en el desarrollo, crecimiento y respuestas al estrés de las plantas. En este estudio, identificamos y analizamos 22 genes a nivel del genoma. Estos genes estaban distribuidos de manera desigual en 11 cromosomas. Usando L. como organismos modelo, construimos un árbol filogenético para clasificar estos genes en seis subfamilias distintas. El análisis de colinealidad reveló 20 pares de genes homólogos entre y, 21 pares entre y, y 14 pares entre y. El análisis de elementos cis-actuantes indicó que los elementos responsivos a la luz eran los más abundantes entre los genes. Los análisis de motivos de proteínas, dominios y arquitectura de genes demostraron que los miembros del mismo subgrupo compartían estructuras similares de exones e intrones y disposiciones de motivos. Además, evaluamos los perfiles de expresión de nueve genes bajo luz, sombra y estrés por frío utilizando análisis de qRT-PCR. Notablemente, y fueron significativamente regulados al alza bajo los tres tipos de estrés. Este estudio proporciona conocimientos fundamentales sobre la familia de genes y ofrece una nueva perspectiva sobre los mecanismos de las respuestas al estrés mediadas por factores de transcripción SBP, así como la adaptación del té Tieguanyin a las variaciones ambientales.