Análisis de Redes de Coexpresión Génica Ponderada Basado en la Estimulación por Lipopolisacáridos y Ácido Poliinosínico: Ácido Policitidílico Proporciona un Conjunto Central de Genes para Comprender los Mecanismos de Respuesta Inmunitaria de la Hemolinfa
Autores: Wang, Yongjie; Chen, Xipan; Xu, Xiaohui; Yang, Jianmin; Liu, Xiumei; Sun, Guohua; Li, Zan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis de Redes de Coexpresión Génica Ponderada Basado en la Estimulación por Lipopolisacáridos y Ácido Poliinosínico: Ácido Policitidílico Proporciona un Conjunto Central de Genes para Comprender los Mecanismos de Respuesta Inmunitaria de la Hemolinfa
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Infección por patógenos
Lipopolisacáridos
Poly I:C
Células inmunitarias
Información del transcriptoma
Respuesta inmune
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
El principal influenciador de la calidad de la acuicultura es la infección por patógenos. Tanto los lipopolisacáridos (LPS) como el ácido poliinosinico:policitosínico (Poly I:C) son reconocidos por el receptor de reconocimiento de patrones (PRR) dentro de las células inmunitarias, un sistema que frecuentemente sirve para emular la invasión de patógenos. La hemolinfa, que funciona como un mecanismo de transporte para las células inmunitarias, ofrece información vital del transcriptoma cuando se expone a patógenos, contribuyendo así a nuestra comprensión de los mecanismos biológicos inmunitarios de la especie. En este estudio, realizamos análisis de perfiles de transcripción bajo la influencia de LPS y Poly I:C en un período de 24 horas. Al mismo tiempo, desarrollamos un Análisis de Redes de Coexpresión de Genes Ponderados (WGCNA) para identificar módulos y genes clave. Además, llevamos a cabo análisis de enriquecimiento de Ontología de Genes (GO) y de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) para investigar las funciones modulares principales. Los análisis de redes de coexpresión revelaron una serie de procesos de respuesta inmunitaria tras el estrés por patógenos, identificando varios módulos clave y genes centrales. Los valiosos recursos genéticos proporcionados por nuestros resultados ayudan a nuestra comprensión de la respuesta inmunitaria en la hemolinfa y promoverán nuestra exploración de los mecanismos moleculares de la infección por patógenos en moluscos.
Descripción
El principal influenciador de la calidad de la acuicultura es la infección por patógenos. Tanto los lipopolisacáridos (LPS) como el ácido poliinosinico:policitosínico (Poly I:C) son reconocidos por el receptor de reconocimiento de patrones (PRR) dentro de las células inmunitarias, un sistema que frecuentemente sirve para emular la invasión de patógenos. La hemolinfa, que funciona como un mecanismo de transporte para las células inmunitarias, ofrece información vital del transcriptoma cuando se expone a patógenos, contribuyendo así a nuestra comprensión de los mecanismos biológicos inmunitarios de la especie. En este estudio, realizamos análisis de perfiles de transcripción bajo la influencia de LPS y Poly I:C en un período de 24 horas. Al mismo tiempo, desarrollamos un Análisis de Redes de Coexpresión de Genes Ponderados (WGCNA) para identificar módulos y genes clave. Además, llevamos a cabo análisis de enriquecimiento de Ontología de Genes (GO) y de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) para investigar las funciones modulares principales. Los análisis de redes de coexpresión revelaron una serie de procesos de respuesta inmunitaria tras el estrés por patógenos, identificando varios módulos clave y genes centrales. Los valiosos recursos genéticos proporcionados por nuestros resultados ayudan a nuestra comprensión de la respuesta inmunitaria en la hemolinfa y promoverán nuestra exploración de los mecanismos moleculares de la infección por patógenos en moluscos.