La caléndula tiene un capítulo con dos tipos de flores: flores de rayos estériles y flores de disco fértiles. Esta distinción hace que la caléndula sea un modelo valioso para estudiar el desarrollo de órganos florales en Asteraceae, donde los factores de transcripción MADS-box desempeñan roles cruciales. Aquí, se identificaron 65 genes MADS-box en el genoma de la caléndula, distribuidos en los 12 cromosomas. Estos genes se clasificaron en tipo I (13 genes) y tipo II (52 genes) según relaciones filogenéticas. La estructura genética del tipo I era más simple que la del tipo II, con menos motivos conservados. El tipo I se dividió además en tres subclases, Malfa (8 genes), Mbeta (2 genes) y M (3 genes), mientras que el tipo II se dividió en dos grupos: MIKC (50 genes) y MIKC* (2 genes), siendo MIKC el que comprendía 13 subfamilias. Muchos genes MADS-box del tipo II tenían funciones evolutivamente conservadas en la caléndula. El análisis de expresión de genes del tipo II en diferentes órganos reveló patrones específicos de órganos, identificando 34 genes relacionados con el desarrollo de órganos florales. Dadas las características distintivas de los dos tipos de flores, cuatro genes se expresaron específicamente solo en los pétalos de un tipo de flor, mientras que veinte genes se expresaron en los estambres de las flores de disco. Estos genes podrían estar relacionados con la formación de diferentes tipos de flores. Nuestra investigación proporcionó un análisis completo y sistemático de los genes MADS-box de la caléndula y sentó las bases para estudios futuros sobre los roles de los genes MADS-box en el desarrollo de órganos florales en Asteraceae.