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Análisis de Genes Relacionados con la Floración Alterada en una Línea de Colza Multi-Silique (L.) zws-ms Basado en la Combinación de Datos de Genoma, Transcriptoma y Proteoma

Autores: Chai, Liang; Li, Haojie; Zhao, Xiaoguang; Cui, Cheng; Zheng, Benchuan; Zhang, Ka; Jiang, Jun; Zhang, Jinfang; Jiang, Liangcai

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Análisis de Genes Relacionados con la Floración Alterada en una Línea de Colza Multi-Silique (L.) zws-ms Basado en la Combinación de Datos de Genoma, Transcriptoma y Proteoma


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Investigado
Colza
Genes
SNP
Proteoma
Multi-silique

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 8

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Basado en investigaciones previas, investigamos más a fondo el rasgo de multi-silique en la línea de colza zws-ms. En este estudio, utilizamos una lista relativamente completa de genes relacionados con la floración en la colza y los comparamos entre zws-ms y su línea near-isogénica (NIL) zws-217. Los genes se estudiaron a niveles de genoma, transcriptoma y proteoma, y luego nos centramos en los genes con polimorfismos de nucleótido único (SNP) no sinónimos o inserciones-borrados de desplazamiento de marco (InDel), encontrando algunos genes en la lista que cambian sus secuencias. Luego, combinados con su anotación y la información de sus ortólogos, ciertos genes como BnaA09g05900D, ortólogo de (), que codifica una proteína MADS-box, se asumieron como probablemente responsables del rasgo de multi-silique. Además, analizamos las Proteínas Acumuladas Diferencialmente (DAPs) entre zws-ms y zws-217, revelando algunos genes involucrados en la recombinación homóloga y las vías de reparación de desajustes. Dado que el desarrollo de flores/siliques es crucial para los cultivos y afecta el rendimiento de la colza, este estudio abrió un camino para comprender profundamente el mecanismo de la formación de flores de múltiples pistilos, lo que puede facilitar investigaciones sobre la producción de colza en el futuro.

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