Análisis de Genes Relacionados con la Floración Alterada en una Línea de Colza Multi-Silique (L.) zws-ms Basado en la Combinación de Datos de Genoma, Transcriptoma y Proteoma
Autores: Chai, Liang; Li, Haojie; Zhao, Xiaoguang; Cui, Cheng; Zheng, Benchuan; Zhang, Ka; Jiang, Jun; Zhang, Jinfang; Jiang, Liangcai
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis de Genes Relacionados con la Floración Alterada en una Línea de Colza Multi-Silique (L.) zws-ms Basado en la Combinación de Datos de Genoma, Transcriptoma y Proteoma
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Investigado
Colza
Genes
SNP
Proteoma
Multi-silique
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Basado en investigaciones previas, investigamos más a fondo el rasgo de multi-silique en la línea de colza zws-ms. En este estudio, utilizamos una lista relativamente completa de genes relacionados con la floración en la colza y los comparamos entre zws-ms y su línea near-isogénica (NIL) zws-217. Los genes se estudiaron a niveles de genoma, transcriptoma y proteoma, y luego nos centramos en los genes con polimorfismos de nucleótido único (SNP) no sinónimos o inserciones-borrados de desplazamiento de marco (InDel), encontrando algunos genes en la lista que cambian sus secuencias. Luego, combinados con su anotación y la información de sus ortólogos, ciertos genes como BnaA09g05900D, ortólogo de (), que codifica una proteína MADS-box, se asumieron como probablemente responsables del rasgo de multi-silique. Además, analizamos las Proteínas Acumuladas Diferencialmente (DAPs) entre zws-ms y zws-217, revelando algunos genes involucrados en la recombinación homóloga y las vías de reparación de desajustes. Dado que el desarrollo de flores/siliques es crucial para los cultivos y afecta el rendimiento de la colza, este estudio abrió un camino para comprender profundamente el mecanismo de la formación de flores de múltiples pistilos, lo que puede facilitar investigaciones sobre la producción de colza en el futuro.
Descripción
Basado en investigaciones previas, investigamos más a fondo el rasgo de multi-silique en la línea de colza zws-ms. En este estudio, utilizamos una lista relativamente completa de genes relacionados con la floración en la colza y los comparamos entre zws-ms y su línea near-isogénica (NIL) zws-217. Los genes se estudiaron a niveles de genoma, transcriptoma y proteoma, y luego nos centramos en los genes con polimorfismos de nucleótido único (SNP) no sinónimos o inserciones-borrados de desplazamiento de marco (InDel), encontrando algunos genes en la lista que cambian sus secuencias. Luego, combinados con su anotación y la información de sus ortólogos, ciertos genes como BnaA09g05900D, ortólogo de (), que codifica una proteína MADS-box, se asumieron como probablemente responsables del rasgo de multi-silique. Además, analizamos las Proteínas Acumuladas Diferencialmente (DAPs) entre zws-ms y zws-217, revelando algunos genes involucrados en la recombinación homóloga y las vías de reparación de desajustes. Dado que el desarrollo de flores/siliques es crucial para los cultivos y afecta el rendimiento de la colza, este estudio abrió un camino para comprender profundamente el mecanismo de la formación de flores de múltiples pistilos, lo que puede facilitar investigaciones sobre la producción de colza en el futuro.