Identificación y análisis de expresión de la familia de genes Alfin-like en tomate y el papel de en estrés por sal y sequía
Autores: Jin, Ruixin; Wang, Juan; Guo, Bin; Yang, Tao; Hu, Jiahui; Wang, Baike; Yu, Qinghui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis de expresión de la familia de genes Alfin-like en tomate y el papel de en estrés por sal y sequía
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Desarrollo de plantas
Respuesta al estrés
Estrés abiótico
árbol filogenético
Expresión génica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción tipo Alfin (AL) son una familia de genes específicos de plantas con un dominio estructural similar a un dedo PHD en el extremo C y un dominio estructural DUF3594 en el extremo N que desempeñan roles importantes en el desarrollo de las plantas y la respuesta al estrés. En el presente estudio, se realizó una identificación y análisis a nivel genómico de la familia de proteínas AL en el tomate cultivado y tres parientes silvestres para evaluar su respuesta a diferentes estreses abióticos. Se identificaron un total de 39 y se clasificaron en cuatro grupos y, basándose en el árbol filogenético y el análisis evolutivo, se mostró que se formaron antes de la diferenciación de monocotiledóneas y dicotiledóneas. Además, el análisis de elementos de acción reveló que varios elementos de respuesta a fitohormonas y a estreses abióticos existían en gran medida en el tomate. Además, un análisis adicional del gen reveló que su expresión fue inducida por estreses de sequía y sal y se localizó en el núcleo. En conclusión, nuestros hallazgos sobre los genes proporcionan información útil para estudios futuros sobre sus funciones y mecanismos regulatorios y ofrecen referencias teóricas para estudiar la respuesta de los genes a estreses abióticos en las plantas.
Descripción
Los factores de transcripción tipo Alfin (AL) son una familia de genes específicos de plantas con un dominio estructural similar a un dedo PHD en el extremo C y un dominio estructural DUF3594 en el extremo N que desempeñan roles importantes en el desarrollo de las plantas y la respuesta al estrés. En el presente estudio, se realizó una identificación y análisis a nivel genómico de la familia de proteínas AL en el tomate cultivado y tres parientes silvestres para evaluar su respuesta a diferentes estreses abióticos. Se identificaron un total de 39 y se clasificaron en cuatro grupos y, basándose en el árbol filogenético y el análisis evolutivo, se mostró que se formaron antes de la diferenciación de monocotiledóneas y dicotiledóneas. Además, el análisis de elementos de acción reveló que varios elementos de respuesta a fitohormonas y a estreses abióticos existían en gran medida en el tomate. Además, un análisis adicional del gen reveló que su expresión fue inducida por estreses de sequía y sal y se localizó en el núcleo. En conclusión, nuestros hallazgos sobre los genes proporcionan información útil para estudios futuros sobre sus funciones y mecanismos regulatorios y ofrecen referencias teóricas para estudiar la respuesta de los genes a estreses abióticos en las plantas.