Caracterización sistemática de factores de transcripción GATA en y validación funcional en estrés abiótico
Autores: Hwarari, Delight; Radani, Yasmina; Guan, Yuanlin; Chen, Jinhui; Liming, Yang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización sistemática de factores de transcripción GATA en y validación funcional en estrés abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
En peligro de extinción
Estrés abiótico
Factores de transcripción GATA
Familia de genes
Análisis filogenéticos
Funciones regulatorias
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
La en la familia es una especie de árbol en peligro de extinción útil por sus beneficios socioeconómicos y ecológicos. Los estreses abióticos (frío, calor y estrés por sequía), entre otros factores, afectan su crecimiento, desarrollo y distribución. Sin embargo, los factores de transcripción GATA (TFs) responden a varios estreses abióticos y juegan un papel significativo en la aclimatación de las plantas a los estreses abióticos. Para determinar la función de los TFs GATA en , investigamos los genes GATA en el genoma de . En este estudio, se identificaron un total de 18 genes GATA, que estaban distribuidos aleatoriamente en 12 de los 17 cromosomas en total. Estos genes GATA se agruparon en cuatro grupos separados basados en sus relaciones filogenéticas, estructuras génicas y arreglos de conservación de dominios. Análisis filogenéticos detallados entre especies de la familia de genes GATA demostraron una conservación de los GATAs y una probable diversificación que impulsó la diversificación de genes en especies de plantas. Además, se mostró que la familia de genes LcGATA estaba evolutivamente más cerca de la de , lo que brinda una visión sobre las posibles funciones de los genes LcGATA. Investigaciones sobre la duplicación de genes LcGATA mostraron cuatro pares de duplicados de genes por el evento de duplicación segmentaria, y estos genes fueron el resultado de una fuerte selección purificada. El análisis de los elementos reguladores -demostró una representación significativa de los elementos de estrés abiótico en las regiones promotoras de los genes LcGATA. Expresiones adicionales de genes a través de análisis de transcriptoma y qPCR revelaron una regulación significativa al alza de LcGATA17 y LcGATA18 en varios estreses, incluyendo estrés por calor, frío y sequía en todos los puntos de tiempo analizados. Concluimos que los genes LcGATA juegan un papel fundamental en la regulación del estrés abiótico en . En resumen, nuestros resultados proporcionan nuevas perspectivas para entender la familia de genes LcGATA y sus funciones regulatorias durante los estreses abióticos.
Descripción
La en la familia es una especie de árbol en peligro de extinción útil por sus beneficios socioeconómicos y ecológicos. Los estreses abióticos (frío, calor y estrés por sequía), entre otros factores, afectan su crecimiento, desarrollo y distribución. Sin embargo, los factores de transcripción GATA (TFs) responden a varios estreses abióticos y juegan un papel significativo en la aclimatación de las plantas a los estreses abióticos. Para determinar la función de los TFs GATA en , investigamos los genes GATA en el genoma de . En este estudio, se identificaron un total de 18 genes GATA, que estaban distribuidos aleatoriamente en 12 de los 17 cromosomas en total. Estos genes GATA se agruparon en cuatro grupos separados basados en sus relaciones filogenéticas, estructuras génicas y arreglos de conservación de dominios. Análisis filogenéticos detallados entre especies de la familia de genes GATA demostraron una conservación de los GATAs y una probable diversificación que impulsó la diversificación de genes en especies de plantas. Además, se mostró que la familia de genes LcGATA estaba evolutivamente más cerca de la de , lo que brinda una visión sobre las posibles funciones de los genes LcGATA. Investigaciones sobre la duplicación de genes LcGATA mostraron cuatro pares de duplicados de genes por el evento de duplicación segmentaria, y estos genes fueron el resultado de una fuerte selección purificada. El análisis de los elementos reguladores -demostró una representación significativa de los elementos de estrés abiótico en las regiones promotoras de los genes LcGATA. Expresiones adicionales de genes a través de análisis de transcriptoma y qPCR revelaron una regulación significativa al alza de LcGATA17 y LcGATA18 en varios estreses, incluyendo estrés por calor, frío y sequía en todos los puntos de tiempo analizados. Concluimos que los genes LcGATA juegan un papel fundamental en la regulación del estrés abiótico en . En resumen, nuestros resultados proporcionan nuevas perspectivas para entender la familia de genes LcGATA y sus funciones regulatorias durante los estreses abióticos.