Los mutantes de color de hoja sirven como excelentes modelos para investigar las vías metabólicas involucradas en la biosíntesis de clorofila, el desarrollo de cloroplastos y la fotosíntesis en las plantas. Este estudio tuvo como objetivo elucidar los mecanismos subyacentes a la formación de color en el mutante de hoja amarillo-verde (YL) mediante el empleo de análisis fisiológicos, citológicos y transcriptómicos para comparar el mutante con plantas de control (tipo salvaje, WT). Las evaluaciones fisiológicas revelaron una reducción en el contenido de clorofila, particularmente de clorofila b, junto con un aumento en el nivel de flavonoides en YL en relación con WT. Los exámenes citológicos indicaron la presencia de cloroplastos defectuosos dentro de las células del mesófilo de los mutantes. El análisis transcriptómico identificó 8205 genes expresados diferencialmente, con 4159 regulados al alza y 4046 regulados a la baja. Se encontró que los genes asociados con el metabolismo de la clorofila, el metabolismo de flavonoides, la fotosíntesis y las vías de señalización desempeñan roles cruciales en el amarillamiento de las hojas. En conclusión, este estudio delineó las diferencias fenotípicas, fisiológicas, citológicas y transcriptómicas entre las hojas de YL y WT, ofreciendo nuevas perspectivas sobre los mecanismos que impulsan el amarillamiento de las hojas.