El análisis multicriterio es una herramienta de toma de decisiones y evaluación de eficiencia para su aplicación tanto en el sector privado como en el público. Su aplicación se precede por la selección de indicadores adecuados y un conjunto homogéneo de variantes, así como métodos adecuados basados en la naturaleza de los datos de entrada. El objetivo de la investigación presentada es resaltar la importancia de seleccionar indicadores adecuados mediante un estudio de caso sobre la salud financiera de un municipio, más precisamente, la eficiencia de la gestión de este municipio. Cuatro indicadores clave, treinta y dos sujetos homogéneos y un método de análisis multicriterio fueron identificados en este estudio basado en los fundamentos teóricos del problema específico. Estos elementos fueron procesados en un total de 14 variantes dependiendo del número de indicadores evaluados. Posteriormente, estos resultados fueron sometidos a verificación estadística junto con la verificación utilizando el índice de Jaccard. Basándonos en los resultados adquiridos, resaltamos la necesidad de una identificación correcta y experta de los conjuntos relevantes de alternativas (la matriz de criterios) y una discusión experta, la cual debería preceder a la selección de los indicadores evaluados y objetivar este proceso de selección tanto como sea posible. Se demostró que la evaluación basada en un bajo número de indicadores es insuficiente, altamente variable y diversa, y estas diferencias se eliminaron parcialmente a medida que aumentaba el número de indicadores evaluados.