Análisis filogenético de los genotipos G y P de las cepas de rotavirus bovino del grupo A aisladas de vacas diarreicas en Vietnam en 2017 y 2018
Autores: Shin, Jihye; Park, Gyu-Nam; Choe, SeEun; Cha, Ra Mi; Kim, Ki-Sun; An, Byung-Hyun; Kim, Song Yi; Moon, Soo Hyun; Hyun, Bang-Hun; An, Dong-Jun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis filogenético de los genotipos G y P de las cepas de rotavirus bovino del grupo A aisladas de vacas diarreicas en Vietnam en 2017 y 2018
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Diversidad genética
RVAs bovinos
Prevalencia
Tipo G
Tipo P
Vietnam
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Este estudio tuvo como objetivo investigar la diversidad genética de los RVAs bovinos de tipo G y P (BoRVAs) prevalentes en Vietnam. Entre 2017 y 2018, la prevalencia de BoRVAs detectados en muestras de diarrea de 8 regiones fue tan baja como 1.9% (11/582). La prevalencia del tipo G fue del 45.5% para G6 y del 18.2% para G10; sin embargo, el 36.3% permanece sin identificar. Curiosamente, todos los BoRVAs fueron investigados como P[11], y no hubo diversidad dentro de este tipo P. Geográficamente, los tipos G6 y G10 no se identificaron en ninguna área específica; más bien, ocurrieron tanto en el norte como en el sur de Vietnam. G6P[11] y G10P[11], que son tipos combinados de G y P, se identificaron en el 71.4% y el 28.6% de las muestras positivas de BoRVA, respectivamente. El análisis del árbol filogenético reveló que el tipo G6 detectado en vacas vietnamitas es similar a cepas derivadas de China, Japón y Corea, mientras que el tipo G10 está estrechamente relacionado con la cepa china. Además, la cepa P11 detectada en vacas vietnamitas es similar a las cepas española y china. La tasa de positividad de BoRVA fue mayor en vacas de menos de 2 meses (3.2%, 3/94) que en aquellas de 2 meses o más (1.6%, 8/488). En resumen, detectamos la presencia de BoRVAs G6P11 y G10P11 en granjas de vacas vietnamitas, y encontramos que eran más predominantes en terneros jóvenes que en vacas mayores.
Descripción
Este estudio tuvo como objetivo investigar la diversidad genética de los RVAs bovinos de tipo G y P (BoRVAs) prevalentes en Vietnam. Entre 2017 y 2018, la prevalencia de BoRVAs detectados en muestras de diarrea de 8 regiones fue tan baja como 1.9% (11/582). La prevalencia del tipo G fue del 45.5% para G6 y del 18.2% para G10; sin embargo, el 36.3% permanece sin identificar. Curiosamente, todos los BoRVAs fueron investigados como P[11], y no hubo diversidad dentro de este tipo P. Geográficamente, los tipos G6 y G10 no se identificaron en ninguna área específica; más bien, ocurrieron tanto en el norte como en el sur de Vietnam. G6P[11] y G10P[11], que son tipos combinados de G y P, se identificaron en el 71.4% y el 28.6% de las muestras positivas de BoRVA, respectivamente. El análisis del árbol filogenético reveló que el tipo G6 detectado en vacas vietnamitas es similar a cepas derivadas de China, Japón y Corea, mientras que el tipo G10 está estrechamente relacionado con la cepa china. Además, la cepa P11 detectada en vacas vietnamitas es similar a las cepas española y china. La tasa de positividad de BoRVA fue mayor en vacas de menos de 2 meses (3.2%, 3/94) que en aquellas de 2 meses o más (1.6%, 8/488). En resumen, detectamos la presencia de BoRVAs G6P11 y G10P11 en granjas de vacas vietnamitas, y encontramos que eran más predominantes en terneros jóvenes que en vacas mayores.