Dieciséis nuevos genomas plastidiales completos en la tribu Loteae (Leguminosae): estructura y análisis filogenético
Autores: Samigullin, Tahir H.; Kopylov-Guskov, Yury O.; Nikitina, Olga V.; Krinitsina, Anastasiya A.; Polevova, Svetlana V.; Kramina, Tatiana E.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Dieciséis nuevos genomas plastidiales completos en la tribu Loteae (Leguminosae): estructura y análisis filogenético
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Tribu
Loteae
Plastidios
Genomas
Relaciones
Filogenéticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La tribu Loteae (Papilioniodeae-Leguminosae), según datos de plastidios, pertenece al clado Robinioide, que también incluye las tribus Robinieae y Sesbanieae. La tribu Loteae contiene 16 géneros y alrededor de doscientos setenta y cinco especies, de las cuales se han estudiado hasta la fecha los genomas plastidiales de cinco especies. Los principales objetivos de nuestro estudio fueron obtener nueva información sobre la estructura del genoma plastidial de los representantes de Loteae con el fin de evaluar la variabilidad del genoma plastidial y reconstruir las relaciones filogenéticas dentro de la tribu Loteae. Realizamos secuenciación, ensamblaje, análisis estructurales y filogenéticos de los genomas plastidiales de Loteae. Todos los plastomas ensamblados de Loteae mostraron una estructura cuadripartita con una longitud total que varía de 150,069 a 152,206 pb y mostraron una estabilidad relativa de los bordes de repetición invertida. Los plastomas de Loteae demostraron una colinealidad completa; los sitios más variables de los plastomas estudiados se encontraron en los espaciadores N-C y 16-D de la región LSC y en el gen 1 dentro del SSC. Todas las relaciones inferidas alcanzaron un soporte máximo con la línea que se separó primero, seguida de y ; es un grupo hermano del clado + . En este estudio, se produjeron relaciones completamente resueltas que representan una columna vertebral de la filogenia plastidial. Los resultados obtenidos demostraron que los genomas plastidiales en la tribu Loteae son estructuralmente conservadores en contraste con las tribus estrechamente relacionadas Robinieae y Sesbanieae.
Descripción
La tribu Loteae (Papilioniodeae-Leguminosae), según datos de plastidios, pertenece al clado Robinioide, que también incluye las tribus Robinieae y Sesbanieae. La tribu Loteae contiene 16 géneros y alrededor de doscientos setenta y cinco especies, de las cuales se han estudiado hasta la fecha los genomas plastidiales de cinco especies. Los principales objetivos de nuestro estudio fueron obtener nueva información sobre la estructura del genoma plastidial de los representantes de Loteae con el fin de evaluar la variabilidad del genoma plastidial y reconstruir las relaciones filogenéticas dentro de la tribu Loteae. Realizamos secuenciación, ensamblaje, análisis estructurales y filogenéticos de los genomas plastidiales de Loteae. Todos los plastomas ensamblados de Loteae mostraron una estructura cuadripartita con una longitud total que varía de 150,069 a 152,206 pb y mostraron una estabilidad relativa de los bordes de repetición invertida. Los plastomas de Loteae demostraron una colinealidad completa; los sitios más variables de los plastomas estudiados se encontraron en los espaciadores N-C y 16-D de la región LSC y en el gen 1 dentro del SSC. Todas las relaciones inferidas alcanzaron un soporte máximo con la línea que se separó primero, seguida de y ; es un grupo hermano del clado + . En este estudio, se produjeron relaciones completamente resueltas que representan una columna vertebral de la filogenia plastidial. Los resultados obtenidos demostraron que los genomas plastidiales en la tribu Loteae son estructuralmente conservadores en contraste con las tribus estrechamente relacionadas Robinieae y Sesbanieae.