Análisis Evolutivo y de Expresión de la Familia de Genes MAGE en el Cerdo
Autores: Zhang, Yu; Tang, Jian; Zheng, Yiwen; Guo, Wanshu; Guo, Yuanyuan; Chang, Minghang; Wang, Hui; Li, Yanyan; Chang, Zhaoyue; Xu, Yuan; Wang, Zhipeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis Evolutivo y de Expresión de la Familia de Genes MAGE en el Cerdo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Antígeno asociado al melanoma
Genes MAGE
Genomas eucariotas
Patrones de expresión
Análisis filogenético
Grupos de genes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
La familia de antígenos asociados al melanoma (MAGE) encontrada en eucariotas juega un papel crucial en la proliferación y diferenciación celular, la espermatogénesis, el desarrollo neural, etc. Este estudio exploró la validación y evolución de los genes MAGE en genomas eucariotas y su distribución y patrones de expresión en cerdos. En total, se encontraron 249 genes MAGE en 13 especies eucariotas. En total, 33, 25 y 18 genes se localizaron en los genomas de humanos, ratones y cerdos, respectivamente. Encontramos ocho, cuatro y tres grupos de genes duplicados en tándem en los genomas de humanos, ratones y cerdos, respectivamente. La mayoría de los genes MAGE en mamíferos se localizan en el cromosoma X. Según el análisis filogenético, los genes de la familia MAGE se clasificaron en 11 subfamilias. El gen NDN en peces cebra fue la raíz de este árbol evolutivo. En total, 10 y 11 genes MAGE en los genomas de humanos y ratones, respectivamente, exhibieron una relación de colinealidad con los genes MAGE en los genomas de cerdos. Tomando los genes de la familia MAGE en cerdos, las subfamilias MAGE tenían estructuras de genes, motivos de proteínas y atributos bioquímicos similares. Usando los datos de RNA-seq de cerdos Duroc y cerdos Rongchang, detectamos que la expresión de los genes MAGE tipo I era más alta en tejidos reproductivos, pero los genes MAGE tipo II se expresaban predominantemente en el tejido cerebral. Estos hallazgos son un recurso valioso para obtener información sobre la evolución y expresión de los genes de la familia MAGE.
Descripción
La familia de antígenos asociados al melanoma (MAGE) encontrada en eucariotas juega un papel crucial en la proliferación y diferenciación celular, la espermatogénesis, el desarrollo neural, etc. Este estudio exploró la validación y evolución de los genes MAGE en genomas eucariotas y su distribución y patrones de expresión en cerdos. En total, se encontraron 249 genes MAGE en 13 especies eucariotas. En total, 33, 25 y 18 genes se localizaron en los genomas de humanos, ratones y cerdos, respectivamente. Encontramos ocho, cuatro y tres grupos de genes duplicados en tándem en los genomas de humanos, ratones y cerdos, respectivamente. La mayoría de los genes MAGE en mamíferos se localizan en el cromosoma X. Según el análisis filogenético, los genes de la familia MAGE se clasificaron en 11 subfamilias. El gen NDN en peces cebra fue la raíz de este árbol evolutivo. En total, 10 y 11 genes MAGE en los genomas de humanos y ratones, respectivamente, exhibieron una relación de colinealidad con los genes MAGE en los genomas de cerdos. Tomando los genes de la familia MAGE en cerdos, las subfamilias MAGE tenían estructuras de genes, motivos de proteínas y atributos bioquímicos similares. Usando los datos de RNA-seq de cerdos Duroc y cerdos Rongchang, detectamos que la expresión de los genes MAGE tipo I era más alta en tejidos reproductivos, pero los genes MAGE tipo II se expresaban predominantemente en el tejido cerebral. Estos hallazgos son un recurso valioso para obtener información sobre la evolución y expresión de los genes de la familia MAGE.