Mantener la variabilidad genética es el propósito más importante de los programas de conservación de animales. El caballo húngaro de sangre fría es una raza indígena que desciende de caballos tradicionalmente utilizados por campesinos. En el último siglo, el papel de los caballos ha cambiado, y han sido reemplazados por innovaciones técnicas y la motorización, lo que ha reducido el tamaño de la población y la diversidad genética. El objetivo de este estudio fue proporcionar información sobre el actual stock de cría y apoyar a las asociaciones de criadores en su trabajo de conservación genética para esta raza local en peligro de extinción. Se evaluaron la calidad del pedigree, los intervalos generacionales, la probabilidad de origen de los genes y la consanguinidad. Encontramos que la raza tuvo un gran efecto de cuellos de botella durante su historia de cría. El nivel de consanguinidad se midió utilizando diferentes métodos, como los coeficientes de Ballou, Wright y Kalinowski.