En este artículo, informamos sobre una anotación completa y consistente del locus que codifica la cadena beta del receptor de células T equinas (TRB), inferida a partir de la reciente ensamblaje del genoma utilizando herramientas bioinformáticas. El locus TRB del caballo abarca aproximadamente 1 Mb, lo que lo convierte en el locus más grande entre las especies de mamíferos estudiadas hasta la fecha, con un número significativamente mayor de genes relacionados con eventos duplicativos extensos. En la región, se identificaron 136 genes TRBV (pertenecientes a 29 subgrupos), 2 TRBD, 13 TRBJ y 2 genes TRBC. La organización genómica general se asemeja a la de otros mamíferos, con un clúster V de 135 genes TRBV ubicados río arriba de dos clústeres TRBD-J-C alineados en tándem y un gen TRBV invertido en el extremo 3 del último gen TRBC. Sin embargo, el repertorio de la cadena beta del caballo se vería afectado por un alto número de genes TRBV no funcionales. Así, consultamos un conjunto de datos transcriptómicos derivados del tejido esplénico de un caballo adulto sano, utilizando cada gen TRBJ como sonda para analizar clonotipos que abarcan la unión V(D)J. Este análisis proporcionó información sobre el uso de los genes TRBV, TRBD y TRBJ y la variabilidad del CDR3 no codificado por la línea germinal. Nuestros resultados demostraron claramente que la cadena beta del caballo constituye un nivel complejo de variabilidad, similar al descrito en otras especies de mamíferos.