Análisis del uso de codones del gen del habla entre los animales
Autores: Mazumder, Tarikul Huda; Alqahtani, Ali M.; Alqahtani, Taha; Emran, Talha Bin; A. Aldahish, Afaf; Uddin, Arif
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Análisis del uso de codones del gen del habla entre los animales
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Gen
Codón
Uso
Sesgo
Mutación
Selección
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 22
Citaciones: Sin citaciones
El gen que codifica proteínas (proteína de caja fork head P2) desempeña un papel importante en la comunicación y los cambios evolutivos. El presente estudio realizó un análisis exhaustivo del sesgo en el uso de codones en el gen entre un grupo diverso de animales, incluidos peces, aves, reptiles y mamíferos. Observamos que en el genoma de los peces, los codones que terminan en C o G se usaron con mayor frecuencia, mientras que en aves, reptiles y mamíferos, los codones que terminan en T o A fueron los más utilizados. Se observó un mayor valor de ENC para el gen, lo que indica un menor CUB. Los gráficos de sesgo de paridad sugirieron que, además de la presión de mutación, otros factores como la selección natural podrían haber influido en el CUB. La distribución de frecuencia de la relación entre ENC observada y ENC esperada reveló que la presión de mutación juega un papel clave en los patrones de uso de codones. Además, el análisis de correspondencia expuso que la composición de la nucleobase bajo el sesgo de mutación afecta el uso de codones del gen. Sin embargo, los gráficos de neutralidad revelaron el papel principal de la selección natural sobre la presión de mutación en el CUB. Además, los patrones de uso de codones para FoxP2 entre los genomas seleccionados sugirieron que la naturaleza ha favorecido casi todos los codones sinónimos para codificar el aminoácido correspondiente. Se observó un uso uniforme de 12 codones sinónimos para FoxP2 entre las especies de aves. La frecuencia de uso de aminoácidos para FoxP2 reveló que los aminoácidos leucina, glutamina y serina eran predominantes sobre otros aminoácidos entre todas las especies de peces, aves, reptiles y mamíferos.
Descripción
El gen que codifica proteínas (proteína de caja fork head P2) desempeña un papel importante en la comunicación y los cambios evolutivos. El presente estudio realizó un análisis exhaustivo del sesgo en el uso de codones en el gen entre un grupo diverso de animales, incluidos peces, aves, reptiles y mamíferos. Observamos que en el genoma de los peces, los codones que terminan en C o G se usaron con mayor frecuencia, mientras que en aves, reptiles y mamíferos, los codones que terminan en T o A fueron los más utilizados. Se observó un mayor valor de ENC para el gen, lo que indica un menor CUB. Los gráficos de sesgo de paridad sugirieron que, además de la presión de mutación, otros factores como la selección natural podrían haber influido en el CUB. La distribución de frecuencia de la relación entre ENC observada y ENC esperada reveló que la presión de mutación juega un papel clave en los patrones de uso de codones. Además, el análisis de correspondencia expuso que la composición de la nucleobase bajo el sesgo de mutación afecta el uso de codones del gen. Sin embargo, los gráficos de neutralidad revelaron el papel principal de la selección natural sobre la presión de mutación en el CUB. Además, los patrones de uso de codones para FoxP2 entre los genomas seleccionados sugirieron que la naturaleza ha favorecido casi todos los codones sinónimos para codificar el aminoácido correspondiente. Se observó un uso uniforme de 12 codones sinónimos para FoxP2 entre las especies de aves. La frecuencia de uso de aminoácidos para FoxP2 reveló que los aminoácidos leucina, glutamina y serina eran predominantes sobre otros aminoácidos entre todas las especies de peces, aves, reptiles y mamíferos.