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Transcriptoma análisis de semillas en estado de dormancia y estado de liberación de dormancia de Nakai

Autores: Zhang, Yonggang; Wu, Feng; Yu, Jingjing; Zhang, Zhiqiang; Huang, Xiangdi; Hou, Huiling; Yang, Limin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Transcriptoma análisis de semillas en estado de dormancia y estado de liberación de dormancia de Nakai


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Hierba perenne
Familia berberidaceae
Medicina china
Germinación de semillas
Mecanismo molecular
Dormancia
Vías de señalización de fitohormonas
Genes reguladores
Secuenciación del transcriptoma
Interacciones proteína-proteína.

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 27

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Es una hierba perenne de la familia Berberidaceae, que es un tónico tradicional en la medicina china. La germinación de las semillas de es difícil. La dormancia es un factor intrínseco que afecta la germinación de las semillas. Elucidar el mecanismo molecular de la dormancia de las semillas y el proceso de levantamiento de la misma es de gran importancia para la cría, conservación y utilización de . Estudios previos han concluido que la ruptura de la dormancia de las semillas requiere estratificación a temperatura cálida seguida de tratamientos de estratificación a baja temperatura. Por lo tanto, realizamos secuenciación del transcriptoma utilizando semillas recién cosechadas y sin tratar (NS), semillas que desarrollaron un embrión cotiledonario después de 90 días de estratificación a temperatura constante a 15 grados Celsius (CS), y semillas que rompieron la dormancia después de 90 días de estratificación a 15 grados Celsius y 60 días de estratificación a 5 grados Celsius (ND) para encontrar los genes responsivos y los genes reguladores que controlan la dormancia. Se identificaron un total de 92,867 genes con expresión diferencial. El análisis de enriquecimiento GO destacó procesos redox, así como componentes estructurales del núcleo y ribosomas. El análisis de enriquecimiento KEGG reveló un enriquecimiento significativo de vías de señalización de fitohormonas, que desempeñan un papel crucial en la liberación de la dormancia de las semillas. Además, se predijeron interacciones proteína-proteína (PPIs) con vías metabólicas de almidón y sacarosa. Este estudio introduce un concepto novedoso para una comprensión más profunda del mecanismo de regulación molecular de y sienta una base teórica para la selección de genes candidatos.

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