Análisis del transcriptoma del proceso de fermentación líquida utilizando paja de maíz como matriz
Autores: Wang, Sheng; Li, Jintao; Fan, Qi; Wang, Shufang; Sun, Changwei; Yan, Meixia
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis del transcriptoma del proceso de fermentación líquida utilizando paja de maíz como matriz
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Especies
Lignocelulosa
Enzimas
Genes
Polisacáridos
Triterpenoides
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 35
Citaciones: Sin citaciones
Una especie de hongo de pudrición blanca, posee la mayor abundancia de enzimas degradadoras de lignocelulosa entre estos hongos, así como una tasa de conversión de carbono relativamente alta. La paja de maíz, como un recurso sostenible importante, se utiliza como sustrato para el cultivo líquido de . Sin embargo, se sabe poco sobre los genes que codifican la degradación de lignocelulosa y las vías biosintéticas de polisacáridos y triterpenoides involucradas en este proceso. Este documento emplea la transcriptómica para descubrir los genes clave involucrados en la degradación de lignocelulosa y la síntesis de polisacáridos y triterpenoides durante la fermentación líquida de utilizando paja de maíz como sustrato, así como sus asociaciones. El análisis de enzimas activas de carbohidratos de genes diferenciales en los resultados de secuenciación se utilizó para analizar los genes relacionados con la degradación de lignocelulosa. Entre estos, se obtuvieron 43 genes centrales que codifican CAZymes después de 0 a 5 días de fermentación, y 25 genes centrales que codifican CAZymes después de 5 a 12 días de fermentación. Los niveles de expresión diferencial de DN3690_c0_g1 (EGL), DN3627_c0_g2 (XYN), DN4778_c0_g1 (XYN), DN2037_c0_g1 (LACC) y DN277_c2_g1 (MnP) se utilizaron para identificar los genes clave. La vía metabólica de síntesis de polisacáridos favoreció la síntesis de manitol, y la expresión de genes de enzimas precursoras de triterpeno reveló niveles de expresión más altos de genes de enzimas clave como ACAT, HMGS y MPK. Un análisis de agrupamiento de correlación de genes relacionados con la degradación de lignocelulosa, polisacáridos y anabolismo de triterpenos durante la fermentación líquida mostró que los genes de degradación de lignocelulosa influían principalmente en el anabolismo de arabinosa y manitol, así como en la síntesis de precursores de triterpenos.
Descripción
Una especie de hongo de pudrición blanca, posee la mayor abundancia de enzimas degradadoras de lignocelulosa entre estos hongos, así como una tasa de conversión de carbono relativamente alta. La paja de maíz, como un recurso sostenible importante, se utiliza como sustrato para el cultivo líquido de . Sin embargo, se sabe poco sobre los genes que codifican la degradación de lignocelulosa y las vías biosintéticas de polisacáridos y triterpenoides involucradas en este proceso. Este documento emplea la transcriptómica para descubrir los genes clave involucrados en la degradación de lignocelulosa y la síntesis de polisacáridos y triterpenoides durante la fermentación líquida de utilizando paja de maíz como sustrato, así como sus asociaciones. El análisis de enzimas activas de carbohidratos de genes diferenciales en los resultados de secuenciación se utilizó para analizar los genes relacionados con la degradación de lignocelulosa. Entre estos, se obtuvieron 43 genes centrales que codifican CAZymes después de 0 a 5 días de fermentación, y 25 genes centrales que codifican CAZymes después de 5 a 12 días de fermentación. Los niveles de expresión diferencial de DN3690_c0_g1 (EGL), DN3627_c0_g2 (XYN), DN4778_c0_g1 (XYN), DN2037_c0_g1 (LACC) y DN277_c2_g1 (MnP) se utilizaron para identificar los genes clave. La vía metabólica de síntesis de polisacáridos favoreció la síntesis de manitol, y la expresión de genes de enzimas precursoras de triterpeno reveló niveles de expresión más altos de genes de enzimas clave como ACAT, HMGS y MPK. Un análisis de agrupamiento de correlación de genes relacionados con la degradación de lignocelulosa, polisacáridos y anabolismo de triterpenos durante la fermentación líquida mostró que los genes de degradación de lignocelulosa influían principalmente en el anabolismo de arabinosa y manitol, así como en la síntesis de precursores de triterpenos.