Análisis del transcriptoma de los estigmas de las flores de L
Autores: Casimiro-Soriguer, Inés; Aguilar-Benitez, David; Gutierrez, Natalia; Torres, Ana M.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis del transcriptoma de los estigmas de las flores de L
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Polinización
Angiospermas
Estigma
Fabaceae
Transcriptoma
DEGs
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La polinización en angiospermas depende de una comunicación compleja entre los granos de polen y los estigmas, clasificados como húmedos o secos, dependiendo de la presencia o ausencia de secreciones en la superficie del estigma, respectivamente. En especies con estigmas húmedos, la cutícula se interrumpe y la presencia de exudados es indicativa de su receptividad. La mayoría de los estudios sobre estigmas se centran en unas pocas especies y familias, muchas de ellas con sistemas de autoincompatibilidad. Sin embargo, hay escaso conocimiento sobre la composición del estigma en Fabaceae, la tercera familia de angiospermas, cuyos estigmas han sido clasificados como semisecos. Aquí informamos sobre el primer perfil transcriptómico y los genes expresados diferencialmente (DEGs) de los estilos y estigmas de L. de líneas endogámicas autofértiles (flores capaces de autofertilizarse en ausencia de manipulación, cuyo exudado se libera espontáneamente) y autosteriles (flores que necesitan ser manipuladas para romper la cutícula y liberar los exudados para ser receptivas). De los 76,269 contigs obtenidos de la ensamblaje de novo, solo el 45.1% de las secuencias fueron anotadas con al menos un término GO. Se asignaron un total de 115,920, 75,489 y 70,801 anotaciones a las categorías de Proceso Biológico (BP), Componente Celular (CC) y Función Molecular (MF), respectivamente, y se identificaron 5918 genes expresados diferencialmente (DEGs) entre las líneas autofértiles y autosteriles. Entre las vías metabólicas más enriquecidas en el subconjunto de DEGs se encontraban las relacionadas con la biosíntesis de aminoácidos, el metabolismo de terpenoides o la transducción de señales. Algunos DEGs se han relacionado con QTLs anteriores identificados para rasgos de autofertilidad, y se discuten sus funciones putativas. Los resultados derivados de este trabajo proporcionan una importante referencia transcriptómica para los procesos de estilo-estigma que ayudan a nuestra comprensión de los mecanismos moleculares involucrados en la fertilización de la haba.
Descripción
La polinización en angiospermas depende de una comunicación compleja entre los granos de polen y los estigmas, clasificados como húmedos o secos, dependiendo de la presencia o ausencia de secreciones en la superficie del estigma, respectivamente. En especies con estigmas húmedos, la cutícula se interrumpe y la presencia de exudados es indicativa de su receptividad. La mayoría de los estudios sobre estigmas se centran en unas pocas especies y familias, muchas de ellas con sistemas de autoincompatibilidad. Sin embargo, hay escaso conocimiento sobre la composición del estigma en Fabaceae, la tercera familia de angiospermas, cuyos estigmas han sido clasificados como semisecos. Aquí informamos sobre el primer perfil transcriptómico y los genes expresados diferencialmente (DEGs) de los estilos y estigmas de L. de líneas endogámicas autofértiles (flores capaces de autofertilizarse en ausencia de manipulación, cuyo exudado se libera espontáneamente) y autosteriles (flores que necesitan ser manipuladas para romper la cutícula y liberar los exudados para ser receptivas). De los 76,269 contigs obtenidos de la ensamblaje de novo, solo el 45.1% de las secuencias fueron anotadas con al menos un término GO. Se asignaron un total de 115,920, 75,489 y 70,801 anotaciones a las categorías de Proceso Biológico (BP), Componente Celular (CC) y Función Molecular (MF), respectivamente, y se identificaron 5918 genes expresados diferencialmente (DEGs) entre las líneas autofértiles y autosteriles. Entre las vías metabólicas más enriquecidas en el subconjunto de DEGs se encontraban las relacionadas con la biosíntesis de aminoácidos, el metabolismo de terpenoides o la transducción de señales. Algunos DEGs se han relacionado con QTLs anteriores identificados para rasgos de autofertilidad, y se discuten sus funciones putativas. Los resultados derivados de este trabajo proporcionan una importante referencia transcriptómica para los procesos de estilo-estigma que ayudan a nuestra comprensión de los mecanismos moleculares involucrados en la fertilización de la haba.