Análisis del transcriptoma bajo estrés por sequía
Autores: Zhang, Siwei; Qi, Xinlan; Zhu, Ruiyan; Ye, Dongdong; Shou, Minyu; Peng, Lulu; Qiu, Minghua; Shi, Min; Kai, Guoyin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis del transcriptoma bajo estrés por sequía
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
ácidos fenólicos
Estrés por sequía
Secuenciación del transcriptoma
Vía biosintética de ácidos fenólicos
Factores de transcripción
Biosíntesis de fenilpropanoides
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los ácidos fenólicos son uno de los principales metabolitos secundarios acumulados con diversas actividades farmacológicas. El estrés hídrico moderado puede promover la acumulación de ácidos fenólicos, mientras que el mecanismo sigue siendo incierto. Por lo tanto, realizamos la secuenciación del transcriptoma bajo tratamiento de sequía. Un total de 47,169 unigenes fueron anotados con éxito en al menos una de las seis principales bases de datos. Se indujeron genes de enzimas clave involucrados en la vía biosintética de los ácidos fenólicos, incluyendo , , , , , y . Se analizaron unigenes anotados como lacasas que se correlacionaron con S, y se obtuvieron siete candidatos que pueden estar involucrados en el paso clave de la biosíntesis de SalB por RA. Se seleccionaron un total de 15 factores de transcripción que se regulaban significativamente al alza a las 2 h y 4 h, potencialmente regulando la biosíntesis de ácidos fenólicos. TRINITY_DN14213_c0_g1 (AP2/ERF) activó significativamente la expresión de y , sugiriendo su papel en la regulación de la biosíntesis de ácidos fenólicos. El análisis de enriquecimiento de GO y KEGG de los genes de expresión diferencial mostró que la biosíntesis de fenilpropanoides y la transducción de señales de hormonas vegetales eran significativamente más altas. La vía dependiente de ABA es esencial para la resistencia a la sequía y la acumulación de ácidos fenólicos. Los patrones de expresión en las bases de datos de sequía y ABA mostraron que cuatro PYLs responden tanto a la sequía como a ABA, y se anotaron y analizaron tres miembros potenciales de la familia SnRK2. El presente estudio presentó un análisis integral del transcriptoma afectado por la sequía, que proporciona una rica fuente para comprender el mecanismo molecular frente al estrés abiótico en .
Descripción
Los ácidos fenólicos son uno de los principales metabolitos secundarios acumulados con diversas actividades farmacológicas. El estrés hídrico moderado puede promover la acumulación de ácidos fenólicos, mientras que el mecanismo sigue siendo incierto. Por lo tanto, realizamos la secuenciación del transcriptoma bajo tratamiento de sequía. Un total de 47,169 unigenes fueron anotados con éxito en al menos una de las seis principales bases de datos. Se indujeron genes de enzimas clave involucrados en la vía biosintética de los ácidos fenólicos, incluyendo , , , , , y . Se analizaron unigenes anotados como lacasas que se correlacionaron con S, y se obtuvieron siete candidatos que pueden estar involucrados en el paso clave de la biosíntesis de SalB por RA. Se seleccionaron un total de 15 factores de transcripción que se regulaban significativamente al alza a las 2 h y 4 h, potencialmente regulando la biosíntesis de ácidos fenólicos. TRINITY_DN14213_c0_g1 (AP2/ERF) activó significativamente la expresión de y , sugiriendo su papel en la regulación de la biosíntesis de ácidos fenólicos. El análisis de enriquecimiento de GO y KEGG de los genes de expresión diferencial mostró que la biosíntesis de fenilpropanoides y la transducción de señales de hormonas vegetales eran significativamente más altas. La vía dependiente de ABA es esencial para la resistencia a la sequía y la acumulación de ácidos fenólicos. Los patrones de expresión en las bases de datos de sequía y ABA mostraron que cuatro PYLs responden tanto a la sequía como a ABA, y se anotaron y analizaron tres miembros potenciales de la familia SnRK2. El presente estudio presentó un análisis integral del transcriptoma afectado por la sequía, que proporciona una rica fuente para comprender el mecanismo molecular frente al estrés abiótico en .